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LncRNA ZEB1‐AS1对B细胞非霍奇金淋巴瘤增殖和凋亡的影响及其下游调控网络的分析

2021-05-11廖成成邓木英莫国君雷丹青夏爱军荣超谭晓虹岑洪卢盛娟

中国癌症防治杂志 2021年2期
关键词:检测

廖成成 邓木英 莫国君 雷丹青 夏爱军 荣超 谭晓虹 岑洪 卢盛娟

B细胞非霍奇金淋巴瘤(B⁃cell non⁃Hodgkin's lymphoma,B⁃NHL)是一种淋巴造血系统恶性肿瘤,其中弥漫大B细胞淋巴瘤(diffuse large B⁃cell lymphoma,DLBCL)是最常见的类型,占非霍奇金淋巴瘤的30%~58%[1]。化疗和免疫化疗是B⁃NHL常用的治疗手段,但部分患者一线治疗后耐药或复发难治,疗效并不理想[2⁃3]。目前在临床实践中,淋巴瘤一线方案均以蒽环类药物为主,如多柔比星(doxorubicin,Dox)。因此,探讨Dox耐药机制,寻找B⁃NHL诊断和治疗新型生物标志物及治疗靶点尤为重要。

淋巴瘤发生发展与转录异常有关,除mRNA水平异常外,还包括基因组中ncRNAs调控能力异常(lncRNAs、miRNAs等)[4]。近年来SALMENA等提出细胞内有一类竞争性内源性RNA(competing endoge⁃nous RNA,ceRNA)假说[5],认为 lncRNAs可通过miRNA反应原件(miRNA response elements,MREs)吸附miRNA,抑制miRNA作用,间接调控蛋白编码基因的表达,从而调节肿瘤进程。可见miRNA在该调控网络中起关键作用[6⁃7]。本研究通过GEO数据集预测与DLBCL预后相关的lncRNAs,探讨lncRNA ZEB1⁃AS1及其与Dox协同对B⁃NHL细胞增殖和凋亡的影响,并构建lncRNA⁃miRNA⁃mRNA ceRNA调控网络,预测下游核心基因,为B⁃NHL诊断和治疗提供新的靶点。

1 材料与方法

1.1 数据来源及分析

数据集1来源于GEO数据集(GSE31312)中DLBCL表达谱数据及患者样本信息(498例)。纳入标准:⑴病理确诊为DLBCL;⑵可获得患者的总体生存时间;⑶可获得标准化lncRNA及mRNA的表达数据。表达谱数据用R语言limma包进行差异基因的筛选;构建Cox回归模型,按照HR>1.5,调整后的P值<0.05,挑选出前20个高风险lncRNA。数据集2为从UCSC XENA数据库(https://xenabrowser.net/datapages/)[8]中选取444例正常组织与47例DLBCL组织的表达数据集,比较HR较高的前8个基因在正常组织和肿瘤组织中的表达量。通过文献查阅,筛……

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