一株牦牛源产细菌素植物乳杆菌SWUN5815全基因组测序及序列分析
2021-05-10陈德纯周晏阳杨发龙
中国农业大学学报 2021年5期
陈德纯 周晏阳 周 泷 杨发龙 汤 承
(西南民族大学 畜牧兽医学院,成都 610041)
乳酸菌(Lactic acid bacteria)是一种能够产生乳酸的革兰氏阳性细菌,广泛存在于自然界中,乳酸菌功能包括维持机体微生态平衡,抑制致病菌在宿主体内定植,并且能够保护肠道粘膜完整性的作用[1]乳酸菌还可以提高机体免疫,通过激活肠道黏膜免疫反应,提高机体对致病菌的反应活性[2]。乳杆菌属(LactobacillusBeijerinck)是乳酸菌中数量最多的属分类,也是目前为止人类研究最多和应用最广的一类益生菌。乳酸菌代谢过程中产生的细菌素为无毒副作用和耐药性的生物活性的多肽[3]。细菌素独特的的抗菌活性,有望在临床抗感染领域发挥一定的作用。基于乳酸杆菌的特异性功效,越来越多的研究表明,乳酸菌是一种未来的抗生素替代品[4-5]。
全基因组测序(Whole-genome sequencing,WGS)可将细菌的完整基因组序列全部测序出来的技术,通过基因组序列的分析和基因功能分析(包括GO、KEGG、COG和NR等),更好地理解同属种之间的差异。全基因组测序技术已成为了一种高效检测手段,目前该技术已经在肠道菌群、土壤和真菌[6-8]微生物群落的分析鉴定中得到了应用。在深入挖掘核心基因组、鉴定特异基因以及功能基因组学研究方面具有重要的意义,为探究未知微生物类群多样性和生物学特性的重要手段。
乳酸菌能够调节肠道菌群的平衡,在机体内起到抑制致病菌的作用,在治疗疾病方面具有代替传统抗生素的潜力。长久以来人们一直致力于寻找能够替代抗生素的益生菌。……
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