基于生物信息学方法分析心肌梗死大鼠miRNA芯片
2021-05-07姚道敏宫剑滨
姚道敏,谢 亮,宫剑滨,朱 静,刘 晶
(1.南京中医药大学药学院,江苏 南京 210023;2.南京大学医学院附属金陵医院心脏内科,江苏 南京 210000)
心肌梗死是导致心脏重塑和慢性心衰发生的常见不良心血管事件,发病率和致死率居高不下,患者病理性心肌改变的分子机制仍未得到充分阐释[1]。微小RNA(microRNA,miRNA)作为非编码RNA的一种,长度在20个核苷酸左右,广泛存在于机体的各个组织细胞内,在基因的表达调控中具有重要的作用[2]。miRNA通常与信使RNA(messenger RNA,mRNA)的3′非翻译区( 3′untranslated region,3′UTRs)或编码序列(coding sequence,CDS)区结合抑制翻译或诱导mRNA降解。miRNA与靶基因的5′非翻译区(5′untranslated regions,5′UTRs)结合能激活转录[3]。有关MicroRNA在心肌梗死发生发展中的研究日益增多。MiR-15、miR-195、miR-122 、miR-181a等miRNA在心肌梗死后表达增加,而MiR-24、miR-138、miR-214、miR-499等miRNA在心肌梗死后表达减少。实验表明根据这一变化规律,相应得使miRNA过表达或抑制能有效改善心肌梗死的症状。特殊的是,MiR-320在心肌梗死后表达减少,过表达MiR-320不能减轻心肌梗死的症状反而促进心肌凋亡和坏死的发生。产生这一现象的原因是MiR-320抑制的靶基因对心脏具有保护作用[2]。MiRNA在心肌梗死中的作用复杂,本研究以microarray芯片结果为切入点,寻找心肌梗死中新的LncRNA-miRNA-mRNA三元关系。
1 材料与方法
1.1 大鼠心肌梗死模型的制备8-10周龄雄性清洁级SD大鼠(275±25) g,6只,由南京大学医学院附属金陵医院提供,实验动物使用许可证号为SCXK(军)2012-0014。随机分为2组(n=6):心肌梗死(MI)组和假手术(sham)组。以50 mg·kg-1的剂量腹腔注射戊巴比妥钠(产品批号:11751,Sigma Aldrich,USA)麻醉大鼠并将其固定在无菌手术台上。心电图机(CardiMax FX-7202,锡尔摩电气有限公司,中国)电极连接在四肢皮下,记录标准导联心电图。……
