杨艳北 许晶 李袁飞

摘要：LuxR家族调控蛋白调控革兰氏阴性细菌群体感应系统，从而影响细菌生物被膜的形成。利用在线生物信息学预测软件，分析LuxR家族调控蛋白序列，对其理化性质、亲水性/疏水性、亚细胞定位、信号肽、二级结构、三级结构、磷酸化位点、跨膜结构域和功能结构域进行分析和预测，为后续研究生物被膜形成机制奠定基础，也为生物被膜增强剂的开发提供新的思路。结果表明：LuxR家族调控蛋白为不稳定的亲水性蛋白;定位在细菌的细胞质中;无信号肽结构，推断其为非分泌性蛋白;二级结构中含有α-螺旋、β-转角、延伸链和无规则卷曲等结构元件;α-螺旋和无规则卷曲对三级结构的稳定和功能发挥具有重要意义;含有5个磷酸化位点，其中丝氨酸磷酸化位点包括第79位、第165位和第171位氨基酸，其中苏氨酸磷酸化位点包括第90位和第211位氨基酸;无跨膜结构域，推测LuxR家族调控蛋白不属于跨膜蛋白;LuxR家族调控蛋白参与细菌群体感应系统，含有2个保守结构域，分别为Autoind_bind和 HTH_LUXR，该蛋白通过这2个保守结构域起到转录调控的作用。

关键词：沼泽红假单胞菌;LuxR;生物信息学;生物被膜

沼泽红假单胞菌是光合细菌的代表菌株之一，属于益生菌的一种，广泛作为动物饲料添加剂和水质净化剂使用。沼泽红假单胞菌自身能够产生生物被膜[1]，利用生物被膜这一天然保护状态能够提高细菌的存活率，增加活菌数量，稳定产品质量。生物被膜是指细菌黏附于接触物表面而形成的极其复杂的三维立体结构，这种复杂的细菌聚集体结构，抗逆性强，是大多数细菌在自然状态下的生长方式。……