4种鬼伞β-1 3-葡聚糖转移酶的生物信息学分析
2021-05-06牛鑫柴倩囡冯九海
牛鑫 柴倩囡 冯九海



摘要:鬼伞是一类菌柄能在短时间内快速伸长并且伞盖易自溶形成墨汁的蘑菇,菌柄在伸长过程中细胞壁以伸长生长为主,细胞壁组分β-1,3-葡聚糖发生重构修饰,GH72家族的β-1,3-葡聚糖转移酶能够将较低聚合度的寡糖转化生成更高聚合度的糖链。β-1,3-葡聚糖转移酶可能参与鬼伞菌柄细胞壁中β-葡聚糖组分的重构修饰。以完成测序并有注释信息的灰盖拟鬼伞(Coprinopsis cinerea)、拟鬼伞(Coprinopsis marcescibilis)、晶粒小鬼伞(Coprinellus micaceus)和小脆柄菇(Psathyrella aberdarensis)等4种鬼伞的β-1,3-葡聚糖转移酶的氨基酸序列为基础,采用TargetP、WOLF PSORT、SignalP、Sompa、TMHMM 2.0、Big-PI Fungal Predictor、MEME和SISS-MODEL等生物信息学分析工具对其开展蛋白质亚细胞定位、细胞信号肽、二级结构、跨膜螺旋、糖基化磷脂酰肌醇(GPI)锚定位点、基序以及三级结构等进行分析,同时对上述序列开展遗传进化关系分析。研究结果可为进一步深入开展该蛋白在菌柄伸长过程中细胞壁β-葡聚糖组分的重构修饰研究作基础。
关键词:真菌细胞壁;菌柄伸长;β-1,3-葡聚糖;细胞壁重构;多序列比对;生物信息学
鬼伞(coprinoid mushrooms)是一类子实体形成后,菌柄能快速伸长,伞盖易自溶形成墨汁的大型担子菌伞菌[1]。旧的分类系统中鬼伞科(Coprinaceae)包含鬼伞属(Coprinus)、小脆柄菇属(Psathyrella)和斑褶菇属(Panaeolus),依据第10版《真菌词典》最新分子系统学研究表明,鬼伞属已移至蘑菇科(Agaricaceae),小脆柄菇提升到科分类级别,旧的鬼伞属中大部分成员被划分至拟鬼伞属(Coprinopsis)、小鬼伞属(Coprinellus)和近地伞属(Parasola),其与小脆柄菇属(Psathyrella)等属组成小脆柄菇科(Psathyrellaceae),也就是现在的鬼伞科[2-4]。鬼伞菌柄的生长方式是一种类似植物胚芽鞘的顶端生长,其主要特征是细胞主要进行伸长生长,细胞基本不进行分裂[5]。……
