2019年广州市甲型H1N1流感病毒全基因组序列的遗传特征分析
2021-05-06陈艺韵陆剑云张周斌李魁彪
中国人兽共患病学报 2021年4期
曹 蓝,吴 迪,陈艺韵,曾 庆,夏 丹,陆剑云,狄 飚,张周斌,李魁彪
长期以来,季节性流感威胁着人类健康,每年造成严重的人群发病和死亡。甲型H1N1流感病毒自2009年首次出现以来,由于不断快速的发生基因变异,已代替了原季节性H1N1流感而持续流行。Mi L等[1]在对1977年以来全球H1N1流感病毒抗原进化模型的研究中发现,在8个主要进化模式中有6个进化模式起源于亚洲,进一步发现,我国南方地区H1N1流感病毒的进化要早于北方地区,提示南方地区H1N1流感病毒在我国H1N1流感传播进化过程起到重要作用。而广州市地处华南地区,是我国重要的经济发展中心,也是包括H1N1流感在内多种传染病流行的重要地区。早期研究发现,广州市流感流行呈现双峰的流行特点,甲型H1N1流感和季节性H3N2流感交替出现[2],同时甲型H1N1流感病毒也是近期广州市流感疫情的主要病原[3]。既往的研究中重点对HA和NA基因进行了变异分析,而对甲型H1N1基因组全序列的分子进化研究相对较少,因此本研究选取7株2019年广州市甲型H1N1流感流行株进行了全基因组测序,为全面掌握近期广州市甲型H1N1流感病毒的分子流行病学特点提供研究数据。
1 材料与方法
1.1毒株来源 收集2019年广州市流感监测哨点医院流感样病例和社区流感暴发疫情病例的呼吸道标本,通过荧光定量RT-PCR方法进行甲型H1N1、甲型H3N2和乙型流感病毒核酸检测(试剂盒购于江苏硕世生物科技公司),并将流感阳性标本接种MDCK细胞系进行病毒分离,培养产物经过血凝实验-血凝抑制试验(HA-HI)对流感病毒培养物进行鉴定(血球为自制豚鼠血,血清由中国疾病预防控制中心提供)。……
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