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基于GEPIA2 和Oncomine 数据库分析ITGA6 基因在卵巢癌中的表达及意义

2021-05-06欧阳振波冯国开尹倩李群张敏李凤吴嘉雯万子贤张秋实

妇产与遗传(电子版) 2021年1期
关键词:数据库差异分析

欧阳振波 冯国开 尹倩 李群 张敏 李凤 吴嘉雯 万子贤 张秋实

卵巢癌是妇科三大恶性肿瘤之一,由于其发病隐匿、症状不典型,患者就诊时已多为晚期,因此预后差[1-3]。盆腹腔种植性播散是卵巢癌的主要转移方式,也是影响其手术及治疗效果的重要原因[2-4]。对卵巢癌转移及种植机制的基因研究,可以用于卵巢癌的分子靶向成像及治疗,也是目前研究的热点[4-6]。整合素(integrin,ITG)是一种广泛存在于上皮细胞及内皮细胞等表面的跨膜糖蛋白,由一种α 和β 亚单位通过非共价键形式构成的异二聚体。作为人体的重要黏附分子,ITG 可介导细胞与细胞间、细胞与基质间的相互作用,并直接参与肿瘤的侵袭和转移过程[6-7]。ITGA6基因表达的整合素α6 是ITG 的一种α 亚单位,可以分别与β1 和β4亚单位结合形成α6β1 和α6β4,参与体内多种重要的生理及病理过程[8-9]。许多研究表明,ITGA6直接参与多种癌症的形成及转移等,在癌组织中的高表达与更差的预后存在显著相关性,如肝癌、胰腺癌、乳腺癌及结直肠癌等[7-11]。尽管也有一些研究探讨了ITGA6在卵巢癌中的表达及其与预后的关系,但是目前的结论尚存在一定的矛盾和争议[5-6]。

基因表达谱数据交互分析数据库2 (Gene Expression Profiling Interactive Analysis 2,GEPIA2)是基于肿瘤基因组计划(the Cancer Genome Atlas,TCGA) 与基因型-组织表达(Genotype-Tissue Expression,GTEx)两大著名转录组数据库建立的可视化癌症大数据分析平台[12]。Oncomine 数据库是当今世界上最大的肿瘤芯片数据库与整合平台[13]。本研究拟通过对GEPIA2 和Oncomine 两大数据库中相关信息的挖掘,分析ITGA6在卵巢癌中的表达及其与分期和预后的关系,为进一步研究ITGA6在卵巢癌发生发展中的作用机制及分子靶向成像和治疗等提供依据和参考。……

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