王智辉，钟媚共，陈秋旋，孟子杰，伍婉婷，郑焱，张鑫

0 引言

乳腺癌是最常见的女性恶性肿瘤，近四十年间，全球乳腺癌发病率保持上升趋势，严重威胁着女性健康[1-2]。乳腺癌是生物学高度异质的恶性肿瘤，临床最为常见且恶性程度较高的是浸润性乳腺癌，根据组织形态进一步分为浸润性导管癌（invasive ductal carcinoma,IDC）和浸润性小叶癌（invasive lobular carcinoma,ILC）等，并以IDC为临床的主要病理类型[3]。然而，同样的病理类型在临床生物学特征及治疗反应性上常常截然不同，这是因为特征基因的突变与异常表达往往更能反映乳腺癌的治疗反应及患者预后[4]，随着高通量基因检测技术的成熟应用，乳腺癌基因特征与临床特征的关系逐渐清晰，由此建立病理基因分型逐步被临床所接受并广泛应用。

乳腺癌基因分型的方法有多种，主要通过基因的表达谱算法和免疫组织化学判读等，虽然不同的分型方法在具体样品的判断中存在差异，但群体的分类重复性上基本相似[5]。临床上公认的四个基因亚型为管腔A型（Luminal A,LumA）、管腔B型（Luminal B,LumB）、人表皮生长因子受体2过表达型（HER2 overexpression,Her2）和基底细胞样型（Basal-like,BasL），其中BasL型基本等同于免疫组织化学分型中的三阴乳腺癌（triple negative breast carcinoma,TNBC）[6]。现已知Her2型乳腺癌的特征是人表皮生长因子受体2（human epidermal growth factor receptor 2,HER2）的过表达及下游通路的持续激活，而其编码基因ERBB2（erb-B2 receptor tyrosine kinase 2）的扩增是HER2蛋白过表达的主要原因[4]，迄今未见系统性报道其余三个基因亚型的基因组拷贝数变异（copy number variations,CNV）特征，因此，本课题组通过全基因组CNV分析，在癌症基因组图谱数据库（The Cancer Genome Atlas,TCGA,https://gdc-portal.nci.nih.gov/）中挖掘出与基因分型相关的CNV并加以验证。……