GPC1基因调节结直肠癌进展及预后的生物信息学分析
2021-04-28史维俊温贺新吴华彰刘牧林
陆 飞,史维俊,温贺新,吴华彰,刘牧林
(1.蚌埠医学院第一附属医院胃肠外科;2.蚌埠医学院生命科学学院 癌症转化医学安徽省重点实验室,安徽 蚌埠 233030)
结直肠癌是全球第2 大致死癌症和第3 大常见恶性肿瘤。2018年,结直肠癌新增病例180万,报告死亡病例88.1万人,占全球新增癌症病例和死亡人数的近10%[1]。尽管在治疗上有显著改善,但晚期患者死亡率仍然较高[2],局部复发和远处转移是结直肠癌患者死亡的主要原因[3]。因此,研究结直肠癌发生发展及预后相关机制及探索新的关键分子可以改善结直肠癌的预防、诊断和治疗。
与正常细胞相比,在不同氧浓度下,癌细胞将摄取更多的葡萄糖,大部分葡萄糖被分解成乳酸,这种现象被称作为“Warburg effect”或称“有氧糖酵解”[4]。癌细胞代谢需要更多的葡萄糖,相比正常细胞却产生了较少的ATP,抑制癌细胞有氧糖酵解成为治疗癌症的一种新策略。癌细胞有许多特性,包括高增殖、侵袭、转移和生存[5],与这些特性相关的癌症信号通路可能会被“Warburg effect”增强[6]。例如,PGAM1 受miR3614-5p 调控,通过激活转化生长因子-β(TGF-β)信号通路,在非小细胞肺癌的发生发展过程中发挥癌基因的作用[7]。
Glypican-1(GPC1)是磷脂酰肌醇家族(GPC1-6)的成员,也是一种硫酸乙酰肝素糖蛋白,通过与糖基磷脂酰醇的C 末端结合而锚定在细胞外膜上[8]。其在诊断早期胰腺癌中的特异性和敏感性达到100%,表明它是理想的胰腺癌早期标志物,且有研究表明它在其他类型的肿瘤中表达上调[9-11]。本研究通过TCGA数据库,利用GSEA富集糖酵解相关通路,获得GPC1在COAD中的表达信息及与临床数据的相关性,并应用R 软件分析GPC1 与结直肠癌临床进展的相关性及其对患者生存预后的影响。……
