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反向分子对接技术在中药活性分子作用机制研究中的应用*

2021-04-17温梓辰张万祥杨玉佩盛文兵彭彩云

中医药导报 2021年8期
关键词:中药数据库研究

温梓辰,张万祥,吴 倩,杨玉佩,谢 谦,钟 辉,盛文兵,彭彩云

(湖南中医药大学药学院中医药民族医药物创新发展国际联合实验室/创新药物研究所,湖南 长沙 410208)

在如今新药研发的热潮中,中医药已逐渐成为研究关注的焦点。然而,中药具有多成分、多靶点的特征,导致中药材的药效物质基础及其作用机制无法明确,从而阻碍了中医药的发展。目前,研究中药材活性成分及其作用机制的主要方法有血清药物化学方法、“谱-效”关系分析方法、药效差示血清色谱法、分子生物色谱法等,但都无法清晰解释中药活性与疗效的内涵。小分子活性化合物与靶点的相互作用并不一一对应,而且通过实验方法预测单个化合物的靶标蛋白是一个耗时且昂贵的过程[1],因此使用计算技术进行虚拟筛选成为前期实验的有力工具[2]。反向对接技术是以小分子化合物为探针,通过空间和能量匹配在靶点数据库中相互识别,按照匹配程度由高到低进行打分和排序,通过排序结果,在数据库中筛选活性化合物潜在的蛋白靶点,以探索其作用机制和副作用等[3-4]。笔者从反向分子对接技术在蛋白靶点预测、作用机制阐明、中药质量标志物筛选及反向筛选技术的组合应用等方面综述其研究进展,以期为中药复杂成分的现代化研究提供理论依据,并讨论其优点和局限性。

1 反向对接在蛋白靶点预测中的应用

中药具有化学成分多样性和活性多样性的特性,复杂的化学成分的协同作用使其作用靶点同样具有复杂性和多样性。……

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