基于TSP家族构建胃癌预后评估模型
2021-04-15刘航卢文卿包博文郑雪莹李冬阳王多车晓芳
刘航,卢文卿,包博文,郑雪莹,李冬阳,王多,车晓芳
中国医科大学附属第一医院,沈阳110001
胃癌是临床常见的消化系统恶性肿瘤之一,在我国其发病率居各类恶性肿瘤的第3位。大多数胃癌患者在初诊时已属中晚期,目前的治疗手段虽能在一定程度上改善患者预后,但其5 年生存率仍然较低。现有的分子预后模型和只针对单一病理类型或临床分期进行地预后评估,并未综合考虑相关分子家族在胃癌中的整体功能和临床应用,具有一定局限性。因此,从分子家族功能角度出发,筛选合适的分子标志物,并将其纳入胃癌预后预测模型,对准确评估胃癌患者预后具有重要意义。凝血酶原(TSP)家族是一类具有Ⅱ、Ⅲ型重复序列且羧基末端区域高度同源的凝血酶原蛋白,共有TSP1、TSP2、TSP3、TSP4、TSP5五个家族成员。TSP家族主要存在于细胞外基质中,可通过与不同的细胞受体结合而参与血管生成。TSP家族能够参与多种肿瘤的发生、发展,但其在胃癌中作用的研究较少。有研究发现,TSP2 和TSP5 是胃癌发生的危险因素[1-2],而TSP4 则是胃癌发生的保护因素[3],这表明TSP家族成员在胃癌中的作用不尽相同。2020年3月—6月,本研究利用人类肿瘤相关的基因表达汇编(GEO)数据库中胃癌数据集,筛选出TSP家族中影响胃癌预后的独立危险因素并构建预测胃癌预后的风险评分(RS)模型,旨在为胃癌预后预测提供科学依据。现报告如下。
1 资料与方法
1.1 资料提取 登录GEO数据库(http://www.ncbi.nlm. nih. gov/geo),从GEO 数据库中下载胃癌样本量最大的GSE62254 数据集,获取胃癌样本转录组测序表达数据和性别、年龄、Lauren分型、临床分期、总生存期等临床资料。……
