邓建忠，刘秀玲，陆文斌，张华，李文晶，吴颉，刘迁

江苏大学附属武进医院 徐州医科大学武进临床学院，江苏常州213017

胃癌是临床常见的消化系统恶性肿瘤，在我国其发病率仅次于肺癌，居第2位，死亡率居肿瘤相关死亡的第3位［1］。我国早期胃癌发现占比较低，仅占20%左右，大多数患者首诊时已属进展期，5 年总体生存率不足50%［2-3］。目前，胃癌发病的确切分子机制尚不清楚，临床亦缺乏早期诊断和预后判断的生物标志物。近年来，随着高通量技术迅速发展，有力地推动了疾病基因组学发展和进步。有研究认为，利用生物信息学方法探索分子改变与疾病预后的关系，能够挖掘对疾病预后判断有效的分子标志物［4］。2020 年8 月，本研究应用生物信息学方法通过GEO数据库获取早期胃癌发生、发展过程中显著差异表达基因（DEGs），然后通过GO 功能注释、KEGG 富集分析和蛋白质相互作用网络（PPI）筛选核心基因，通过Kaplan-Meier 生存分析进一步筛选与预后相关的核心基因，旨在为早期胃癌的预后判断提供新的视角。现报告如下。

1 材料与方法

1.1 微阵列数据库检索 以“early gastric cancer，Homo”为关键词，从GEO数据库（https：//www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/）中获得人类早期胃癌基因芯片数据集。数据集需要同时提供早期胃癌组织和正常胃组织的基因芯片，共筛选出GSE3438、GSE55696 两个微阵列数据集。GSE3438数据集基于GPL2912平台（人类基因组功能分析中心KUGI 14K），GSE55696 数据集基于GPL6480 平 台（Agilent-014850全人类基因组芯片4×44K G4112F）。所有数据在线免费获取。

1.2 DEGs 数据处理 利用GEO2R（https：//www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/geo2r/）在线分析工具筛选早期胃癌组织与正常胃组织的DEGs，以调整后的P 和|logFC|为筛选指标。……