Linc00355在结肠癌中表达上调并促进肿瘤细胞增殖和侵袭
2021-04-02李玖明崔凯飒黄朝晖
李玖明,崔凯飒,王 雪,黄朝晖
结肠癌作为临床常见的一种恶性肿瘤,近年来发病率和死亡率均呈现逐年升高的趋势[1]。结肠癌的发病机制复杂,涉及遗传学、表观遗传学以及肿瘤微环境等多个因素的调控。在生物体中,通常可根据其是否具备蛋白编码功能将RNA分为编码RNA及非编码RNA。近年研究已证实,非编码RNA并非是基因转录的“噪音”,而是具有重要的生物学功能[2]。其中长度>200 bp的长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)广泛存在于细胞核和细胞质中。LncRNA可通过多种机制调控生理、病理过程,不仅影响细胞生长、分化、迁移和凋亡等功能,还在疾病的诊断和治疗中具有重要的应用价值。
有研究发现,Linc00355在胃癌中表达上调,并通过调节Wnt/β-连环蛋白(β-catenin)通路促进细胞增殖[3]。在头颈部鳞状细胞癌中高表达的Linc00355可通过调控微RNA(microRNA,miR)-195/HOXA10信号轴促进细胞迁移、侵袭及上皮-间质转化[4]。但Linc00355在结肠癌中的功能和机制目前尚不清楚。
本研究基于肿瘤基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)等数据库结肠癌转录组数据,发现Linc00355在肿瘤中表达显著上调,并可能是一个结肠癌潜在的新预后指标。通过生物信息学方法预测与Linc00355相关的靶基因,进行基因本体(Gene Ontology,GO)功能富集分析,预测Linc00355在结肠癌中的功能以及分子调控机制,并通过细胞实验初步探讨Linc00355对结肠癌细胞生物学功能的影响,以期为结肠癌的诊断和治疗提供新的靶点。
1 材料与方法
1.1 细胞、试剂及仪器
结肠癌细胞株HCT116购自美国菌种保藏中心。DMEM购自美国HyClone公司,胰蛋白酶、青霉素/链霉素购自中国碧云天生物技术公司,胎牛血清(fetal bovine serum,FBS)购自美国Gibco公司,LipofectAMINE 2000购自美国Invitrogen公司。……
