miR-197结合HNRNPD的5’UTR区上调其蛋白表达
2021-04-02杨丝雨王雨萌郑煜芳
罗 婧,杨丝雨,吴 宇,王雨萌,郑煜芳,
(1.复旦大学 生命科学学院 发育生物学研究所, 上海 200433; 2.复旦大学附属妇产科医院, 上海 200011)
microRNA最早在1993年被报道发现[1],是一类长度为19~25nt的非编码小RNA.通常microRNA通过与靶基因mRNA的3’UTR互补配对抑制靶基因的翻译,降低其稳定性.已有研究表明,microRNA 5’端的种子序列(seed sequence)会和靶基因mRNA的3’UTR通过完全碱基互补配对形成microRNA诱导的沉默复合物(microRNA-Induced Silencing Complex, miRISC),该复合物会介导mRNA的切割和降解[2].而microRNA与3’UTR区段不完全的碱基配对则主要导致mRNA的翻译沉默[3].除了与3’UTR的常规相互作用外,最近的研究表明在转录后调控中microRNA也可以与靶基因mRNA的5’UTR区[4]或编码区(CDS)结合[5-6].
microRNA介导的基因调节在发育和疾病调控中都发挥了重要的作用.我们实验室前期工作发现,MECP2复制会上调miR-197,并促进大脑皮质发育中的神经发生[7].hsa-miR-197从1p13.3染色体转录,成熟的miR-197-3p具有22个核苷酸[8].miR-197直系同源基因仅在一些灵长类动物(人、恒河猴、西部大猩猩、侏儒黑猩猩、黑猩猩)和部分其他哺乳动物,包括牛、狗、马,山羊和兔子中被鉴定出,表明其在灵长类动物和这些哺乳动物中具有重要的作用.此外,miR-197还是包括人胶质母细胞瘤[9]在内的几种癌症的生物标志物[10].因此,我们在几种人类细胞中寻找hsa-miR-197-3p的潜在靶基因,包括人诱导多能干细胞hiPSC,人髓核细胞hNPC,人神经元,人胚胎肾细胞293T和人神经胶质瘤细胞U251.我们一共鉴定出9个在这些细胞中均高表达的潜在靶基因,qRT-PCR结果显示过表达miR-197的确可以下调大多数靶基因的表达,但是miR-197对异质核糖核蛋白D0基因(HNRNPD)的表达却有……
