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应用HID Ion GeneStudioTM S5 测序系统探讨毛干样本线粒体DNA异质性

2021-03-30程凤张庆霞陈成建李万婷张家榕张更谦严江伟

法医学杂志 2021年1期
关键词:检测

程凤,张庆霞,陈成建,李万婷,张家榕,张更谦,严江伟

1.山西医科大学法医学院,山西 太原030001;2.北京市公安司法鉴定中心,北京100192

线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)与核DNA 相比,由于较高的拷贝数量,检测样本的需求量低,对降解的现场生物检材,如毛发、陈旧尸骨、指甲等样本的检测具有优势[1]。但目前绝大多数情况下仅对mtDNA 高变区Ⅰ和mtDNA 高变区Ⅱ进行双脱氧链终止法(dideoxy chain-termination method)检测,由于所检测突变位点的数量有限,使其难以准确将无关个体进行区分[2]。随着测序技术的不断发展,以规模化平行测序为主的二代测序技术逐渐应用于法庭科学领域[3]。

由于二代测序技术具有可对mtDNA 进行多样本多位点同时检测的优势[4],使mtDNA 个体识别能力得到一定的提高[5]。本研究使用Precision ID mtDNA Whole Genome Panel试剂盒(美国Thermo Fisher Scientific 公司)[6]对线粒体全基因组进行扩增,应用HID Ion GeneStudioTMS5 测序系统(美国Thermo Fisher Scientific 公司)对线粒体全基因组分析检测,并对其分型结果进行探讨,为法庭科学的应用提供参考。

1 材料与方法

1.1 样本收集

按照“知情同意”原则,分别采集8 名汉族无关个体的口腔拭子,静脉血及额、顶、颞部、会阴部毛发样本各1 份,每份毛发样本包含2 根毛发。样本总共为48 份。

1.2 样本处理

将口腔拭子和静脉血涂卡后室温放置,晾干后常温储存。对毛发样本使用以下步骤进行处理[7]。首先,剪取距离毛根2 cm 处长度为2 cm 毛干样本,使用200 μL 1%十二烷基硫酸钠(sodium dodecyl sulfate,SDS)溶液浸泡,以离心半径10 cm,1 000 r/min,离心5 min,弃去上清液。加入200 μL 纯水浸泡,以离心半径10 cm,1 000 r/min,离心5 min,弃去上清液。再使用400 μL 无水乙醇浸泡10 min 后弃去所有上清液,晾干后常温储存。……

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