于锦霞,王 莹,郝建霞，高延娥,毕宏生，4,解孝锋

0引言

在病原微生物和病原体的研究诊断中，传统的技术手段主要依赖于对微生物的分离和纯化培养，然而研究表明目前有99%以上的微生物种类是无法进行体外培养的。常规基于聚合酶链式反应(polymerase chain reaction，PCR)检测技术的病原体分析方法虽然可以快速的检测病原微生物，但是需要根据已知基因序列合成引物，因此，PCR技术只能用于对已知病原微生物的检测，而对未知病原体则显得束手无策[1-3]。近年来，二代测序(next generation sequencing，NGS)技术凭借其通量大、准确性高、无需微生物培养等诸多优势，极大地推动了以宏基因组学为代表的微生物相关领域的快速发展[4-5]。随着测序成本的快速降低，宏基因组学技术被逐步应用于病原体诊断和病原微生物的研究中，有助于提高临床诊断准确性，促进病原微生物致病机制研究[6-7]。

眼部微生物对眼睛的正常生理状态起着重要作用，微生物群落结构的变化可能会导致眼部疾病[8]。早在1907年，Axenfeld就首次尝试对眼部微生物进行研究[9]。然而，由于眼睛具有精细的解剖结构，难以获得足量的样本、传统诊断技术的局限性等原因[2]，导致人们对眼部微生物群落的研究十分不足，对眼部微生物群及其功能也所知甚少[10]，因此对眼部疾病的诊断及治疗也存在很多困难。宏基因组学开创的无需假设病原体的诊断方法，凭借其快速、高效和准确的分析优势，在多种眼部疾病的诊断中广泛应用，尤其是眼部感染性疾病[8]，为提高某些眼科疾病尤其是眼部感染性疾病的诊断准确性、优化治疗方案奠定了技术基础[2]，现对宏基因组学技术在眼科疾病诊断中的应用进行综述。……