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低深度全基因组测序技术在产前诊断中的研究进展

2021-03-26李奉瑾姚欣雨张玉萍

国际妇产科学杂志 2021年1期
关键词:检测

李奉瑾,姚欣雨,张玉萍

2012 年《出生缺陷防治报告》指出,我国出生缺陷发生率为5.6%[1]。据统计染色体病占出生缺陷遗传性疾病的80%以上[2],是由染色体结构或数目异常导致的疾病。其中多数染色体数目异常可导致流产和死胎,仅少部分三体和性染色体异常可存活,而染色体缺失、重复等结构异常,特别是微缺失微重复结构异常所引起的疾病,在出生缺陷疾病中占很大比例。此类患儿智力低下、发育迟缓、多系统性畸形[3-4],目前临床尚无有效治疗措施,给家庭和社会带来巨大的经济负担。

染色体核型分析技术是产前诊断的金标准,其实验周期长,不能检测5 Mb 以下的拷贝数变异(copy number variations,CNVs)。Wapner 等[5]研究发现在3 822 例核型正常的标本中,2.5%(96/3 822)存在致病或可能致病CNVs。Wang 等[6]对3 398 例羊水样本检测发现,3%(102/3 398)的样本存在致病性拷贝数变异(pCNVs),其中0.97%(33/3 398)CNVs 片段小于5 Mb。目前临床上用于CNVs 检测的技术是染色体微阵列分析技术(chromosomal microarray analysis,CMA),其分辨率高,可检测核型分析无法检出的微缺失和微重复,常用于检测产前超声异常但核型分析正常的胎儿[7],已成为国外推荐的一线检测方法。但是CMA 的芯片探针设计有限,导致其对pCNVs 阳性检出率较低[8],而且其通量低、成本高的特点限制了在我国的广泛应用,不能缓解我国产前诊断供给不足的压力。随着分子诊断技术的发展,低深度全基因组测序技术(copy number variation sequencing,CNV-seq)可实现对产前染色体微缺失、微重复的检测,检测成本较CMA 低,通量高,为临床提供了新的检测手段。

1 CNV-seq 技术原理及特点

CNV-seq 技术基于下一代测序技术,采用边合成边测序的原理,对样本DNA 进行全基因组水平的检测,将测序结果与参考基因组进行比对,进行生物学分析以发现受检样本的CNVs。……

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