苦豆子SaLDC 密码子偏好性分析、优化及原核表达
2021-03-09洪园淑周玉梅李文娟刘
中成药 2021年2期
关键词:优化
洪园淑 周玉梅 李文娟刘 萍∗
(1.宁夏优势特色作物现代分子育种重点实验室,宁夏银川 750021;2.宁夏大学农学院,宁夏银川 750021)
密码子使用偏好性,即编码同种氨基酸的密码子在不同物种中使用频率不完全相同的现象[1]。有研究表明高表达基因倾向于使用最优密码子,密码子使用偏好性与基因表达水平之间的关系已在拟南芥、豌豆和云杉等植物中报道[2-4];对于拟南芥和水稻的密码子使用模式也已得到广泛研究,虽然这2 种植物的密码子使用模式不同,但研究发现其使用偏好性均与基因碱基组成、表达水平和CDS长度等有关[5]。密码子使用偏好性直接影响蛋白的表达,充分利用密码子的使用偏好性策略可提高异源蛋白表达水平[6]。密码子优化技术对一些重要功能蛋白质和关键酶的生物学结构和功能研究有重要作用,可有效提高丙酮酸脱羧酶[7]、脂肪酶[8]、T4 溶菌酶[9]等多种异源蛋白质的表达,也为利用大肠杆菌等模式菌株工业化高效生产异源蛋白质提供了很好的发展前景。
苦豆子Sophora alopecuroides L.中苦参碱和氧化苦参碱具有抗炎、抗肿瘤、调节免疫功能等多种作用[10],赖氨酸脱羧酶基因是合成苦参碱和氧化苦参碱的关键酶基因,有学者对东北石松、蛇足石杉、狭叶羽扇豆、桑树、苦参、野决明等植物的赖氨酸脱羧酶基因开展研究,发现其通过催化赖氨酸脱羧生成尸胺,最终转化为苦参碱和氧化苦参碱[11-15]。目前关于赖氨酸脱羧酶基因的研究大多是探讨基因表达与代谢产物尸胺之间的关系,鲜有从密码子角度研究其在翻译进程中的调控机制和调节自身表达水平。……
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