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猪繁殖与呼吸综合征病毒类NADC30毒株与JXA1-R疫苗株荧光定量PCR鉴别检测方法的建立及应用

2021-03-09周新宇陈鑫鑫乔松林郭振华邓瑞广张改平

河南农业科学 2021年1期
关键词:标准检测方法

周新宇,陈鑫鑫,乔松林,郭振华,李 睿,邓瑞广,张改平

(1.河南农业大学 动物医学院,河南 郑州 450002; 2.河南省农业科学院 动物免疫学重点实验室,河南 郑州 450002)

猪繁殖与呼吸综合征(Porcine reproductive and respiratory syndrome,PRRS)是由猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)引起的以妊娠母猪发生流产、木乃伊胎、死胎及弱胎等繁殖障碍以及仔猪与育肥猪呼吸道疾病为主要特征的病毒性传染病[1-2],该病在全球范围内传播,给世界养猪业造成了巨大的经济损失。PRRSV是一种有囊膜的单股正链RNA病毒,基因组全长约15 kb,含有10个开放阅读框[3-4]。ORF1a和ORF1b分别编码pp1a和pp1ab多聚蛋白,pp1a和pp1ab分别被酶切裂解为至少16种非结构蛋白[5-6]。其中,非结构蛋白Nsp2是不同毒株基因组差异最大的区域[7]。2006年,我国暴发了由高致病性PRRSV(High pathogenic PRRSV,HP-PRRSV)引发的以高热、高发病率和高死亡率为特征的PRRS疫情,HP-PRRSV在Nsp2蛋白序列中存在30个氨基酸的不连续缺失[8-9];2012年,我国报道了与PRRSV经典毒株NADC30核苷酸相似性很高的毒株,命名为类NADC30毒株(NADC30-like strain),其在Nsp2蛋白上存在131个氨基酸的不连续缺失[10-11]。自2013年以来,类NADC30毒株检测率急剧上升,并且类NADC30毒株与其他田间毒株重组频繁,迅速成为河南省乃至全国的优势流行毒株[12-14]。

PRRSV的检测方法有很多种,包括病毒分离和鉴定、ELISA、间接免疫荧光试验(IFA)、血清中和试验(SN)、实时荧光定量PCR(Real-time PCR)、逆转录环介导等温扩增(RT-LAMP)等方法[15-16]。但在实际的生产应用中,大部分方法只能检测而无法区分不同PRRSV毒株。运用荧光定量PCR技术和基因测序等分子生物学技术是目前鉴别检测PRRSV最有效的方法[17],根据Nsp2基因序列建立的荧光定量PCR检测方法是目前用于区分PRRSV不同毒株的主要方法。……

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