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基于多数据集分析10型胶原α1链和分泌型磷蛋白1在肺腺癌中的表达及临床意义

2021-03-07刘美岑刘蕾

癌症进展 2021年24期
关键词:肺癌数据库因素

刘美岑,刘蕾

解放军北部战区总医院呼吸与重症医学科,沈阳 110016

肺癌是最常见的恶性肿瘤之一,是肿瘤相关死亡的主要原因。非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)是肺癌的主要组织学亚型,占肺癌患者的85%。肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)和肺鳞状细胞癌(lung squamous cell carcinoma,LUSC)是最常见的 NSCLC 亚型。其中,LUAD是NSCLC中最常见的组织学亚型,占NSCLC的50%以上。大约70%的肺癌患者被诊断时为晚期,此时患者已经错过了接受手术、化疗和放疗的机会。中晚期就诊、缺乏可靠的生物标志物、不精准的治疗靶点已成为治疗LUAD的主要障碍。因此,早期诊断和治疗对于改善患者的预后和生活质量至关重要。10型胶原α1链(collagen typeⅩ alpha 1 chain,COL10A1)基因编码的产物是10型胶原蛋白的α1链,是一种主要的间质基质成分。它通过形成同源三聚体,组成10型胶原蛋白。COL10A1在许多实体肿瘤中表达升高,如结肠癌、食管癌和乳腺癌,并在关键的细胞过程中发挥重要作用,如细胞增殖、迁移、侵袭和肿瘤血管生成。分泌型磷蛋白1(secreted phosphoprotein 1,SPP1)是一种分泌型磷酸化糖磷蛋白,人类

SPP1

基因位于第4号染色体(4q13)上,有7个外显子和6个内含子。该蛋白可由多种细胞分泌,如破骨细胞、巨噬细胞、上皮细胞和内皮细胞,涉及多种生物学功能。本研究利用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)等数据库中的基因组和临床数据,运用生物信息学技术分析

COL10A1

、

SPP1

mRNA表达与LUAD诊断和预后的关系,预测COL10A1和SPP1参与LUAD发生发展的作用机制,探讨COL10A1和SPP1在LUAD诊断及预后中的意义。

1 资料与方法

1.1 资料收集

从TCGA公共数据库(https://tcga-data.nci.nih.gov/)下载

COL10A1

和

SPP1

基因mRNA测序数据集及与之相一致的患者临床资料。仅保留临床资料和生存信息完整的病例,共纳入LUAD患者594例。……
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