SLC7A2作为肝细胞癌新的生物标志物研究
2021-03-05母波赵春艳胡先华张人丹
母波,赵春艳,胡先华,张人丹
(川北医学院,1.基础医学院;2.四川省医学影像重点实验室,四川 南充 637000)
肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)占原发性肝细胞癌的90%[1],是世界上第四大癌症死亡原因[2-3]。虽然肝细胞癌的预防、早期诊断和综合治疗已经取得了较大进展,但术后复发率很高,预后不良仍然是肝细胞癌临床面临的重大难题[4]。因此,急需进一步探讨肝细胞癌分子生物学特征和发病机制。L-精氨酸是一种半必需氨基酸,是蛋白质生物合成的底物以及一氧化氮和多胺的前体,其在调节细胞增殖和分化中起着至关重要的作用[5-6]。有研究[7-8]表明,L-精氨酸与肿瘤的发生和发展有关。溶质载体家族7成员2(SLC7A2,也称为CAT2)是半必需氨基酸L-精氨酸(L-Arg)的诱导型转运蛋白[9]。Coburn等[10]研究表明,SLC7A2在调节结肠炎相关癌变(CAC)的乙氧基甲烷(AOM)-DSS模型中结肠肿瘤发生中起作用。SLC7A2在慢性结肠炎的发生中对CAC的保护具有重要作用,并表明炎症性肠病(IBD)中SLC7A2的减少可能会导致CAC风险[11]。Kesavardhana等[12]通过分析预后良好与不良的患者的基因表达谱,确定了SLC7A2基因的表达与乳腺癌患者具有较为明显的生存优势相关;并基于回归分析进一步建立了SLC7A2作为一种新型的乳腺癌独立预后生物标志物。这些发现提示SLC7A2可能在肿瘤发生中起关键作用。然而,SLC7A2的表达水平及其在HCC中的作用尚不清楚。本研究通过综合生物信息学分析确定SLC7A2在HCC和正常人群表达差异,并探讨其在HCC中的临床意义。
1 材料和方法
1.1 癌症基因组图谱(TCGA)数据库中的生物信息学分析
从TCGA-LIHC数据集检索377个原发性肝细胞癌组织和50个正常对照的3级数据,如mRNA-seq数据、甲基化数据和临床数据。……
