利用生物信息技术分析喉癌的关键基因
2021-02-05董周威王启威张丽萍林丽红
医学研究杂志 2021年1期
董周威 王启威 张丽萍 林丽红 徐 丹
喉癌的发生率在呼吸道肿瘤中位居第2位,仅次于肺癌,每年新增病例超过15万,大多数的喉癌患者处于临床Ⅲ期和Ⅳ期才被发现,喉癌的发生率和病死率较高,这就要求通过有针对性的筛查寻找用于喉癌早期诊断的分子标志物和治疗靶点[1]。喉癌的病因复杂,与环境和生活方式有关,如吸烟、饮酒、接触有毒物质、饮食习惯、辐射、乳头状瘤病毒感染和咽喉返流等[2]。喉癌的治疗方式在过去几年发生了巨大的变化,放射治疗和外科手术方法进行了很大的改进,还出现了新的靶向治疗方法,多种治疗方案综合运用有利于提高喉癌患者的总生存率[3]。然而,如何选择最合理的治疗方案仍然是一个亟待解决的问题。尽管喉癌相关的研究很多,但分子标志物目前还没有用于喉癌患者的诊断、治疗和管理。因此,研究喉癌发生、发展的分子机制,制定有效的诊断和治疗策略尤为重要。在过去的几十年中,微阵列技术和生物信息学分析被广泛应用于基因水平的癌症研究,通过临床大数据筛选出与肿瘤发生、发展和预后密切相关的基因,有助于识别喉癌发生、发展过程中的差异表达基因和功能途径。本研究从GEO数据库中下载并分析了2个微阵列数据集,以获得喉癌组织和非癌组织之间的差异基因。随后,进行了GO和KEGG途径富集分析和PPI网络分析,以帮助了解喉癌发生和发展的分子机制,然后再利用TCGA数据库验证结果,并对关键基因进行深入分析,共鉴定出218个差异基因和8个关键基因,为喉癌早期诊断提供了新的分子标志物及靶向治疗提供新的靶点。……
登录APP查看全文
