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20种中药基原植物鲨烯合酶基因的生物信息学分析

2021-02-03王琴波王雨晴陈观水

中草药 2021年3期
关键词:植物

王琴波,王雨晴,杨 谨,陈观水

福建农林大学生命科学学院,福建 福州 350002

三萜类化合物是一类具有抗肿瘤、抗病毒、降血糖、调血脂等多种生物活性的植物次生代谢产物,在太子参、人参、甘草等中药基原植物中广泛存在[1-3]。三萜类化合物的结构与生物合成过程比较复杂,关于合成途径中的关键酶的研究是热点之一[4]。研究表明,三萜类化合物主要有两条合成途径生成,即甲羟戊酸(mevalonate pathway,MVA)和甲基-赤藓醇-4-磷酸途径(2-methyl-D-erythritol-4-phosphate,MEP)途径,其中MVA 途径是植物三萜类化合物合成的主要途径[5-8]。在MVA 途径中,鲨烯合酶(squalene synthase,SQS)位于三萜合成通路的分支点上,决定着法尼基焦磷酸的流向,是三萜类化合物生物合成途径中一个关键酶,其含量及活性决定了植物该物质的产量,也是三萜皂苷合成代谢中的一个重要的限速酶[9-14]。目前,已从各种各样的生物,如动物[15]、人类[16]、真菌[17]、植物[9]中成功分离了鲨烯合酶编码基因序列近1000 条。通过对SQS 的结构及理化特性分析表明,不同来源的SQS 在功能位点、结构特征存在一定的差异。因此,鲨烯合酶作为三萜类化合物代谢途径中关键调控酶备受关注,具有重要的研究意义。

本研究运用生物信息学相关软件及其分析方法,对太子参等《中国药典》2015年版[18]收录的20 种中药基原植物中SQS 蛋白氨基酸序列的理化特性、跨膜结构域、亚细胞定位、亲水性进行比较与分析,并构建SQS 蛋白家族的系统发育树。为进一步研究植物SQS 的功能与结构特征和调控植物三萜类化合物的生物合成提供依据。……

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