基于RNA-seq 技术的罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)不同组织转录组比较分析*
2021-02-03李喜莲顾志敏慎佩晶张宇飞程海华陈雪峰
李喜莲 顾志敏 慎佩晶 徐 洋 张宇飞 高 强 程海华 陈雪峰
(农业农村部淡水渔业健康养殖重点实验室 浙江省淡水水产遗传育种重点实验室 浙江省淡水水产研究所 湖州 313001)
罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii), 又称淡水长臂大虾、马来西亚大虾, 动物学分类上属于节肢动物门(Arthropoda), 软甲纲(Malacostraca), 十足目(Decapoda), 长臂虾科(Palaemonidae), 沼虾属(Macrobrachium), 在各种类型的淡水和半咸水中都能生活, 易养殖且体型肥大, 肉质鲜美。因其适应能力强、生长速度快, 罗氏沼虾已成为我国重要的淡水养殖虾类之一。
近年来对罗氏沼虾的研究主要包括遗传多样性研究, 性腺发育、基因克隆及生长等方面的研究。其中在多样性研究中, 以微卫星为研究对象的如吕敏等(2019)研究异型雄性罗氏沼虾遗传多样性, 戴习林等(2017)对种群 SSR 分析中样本量及标记量对遗传多样性指标的影响进行分析; 或对各不同群体进行遗传多样性研究(董丁健等, 2020; 冯艺, 2018; 孙成飞等, 2015); 周晓敏等(2020)选取60 个SNP 位点对养殖群体和选育群体进行多样性研究。罗氏沼虾雌激素相关受体(Estrogen-related receptor, ERR)成为研究卵巢发育的一个重要基因(赵苗鑫等, 2017; 刘金磊,2018; 刘金磊等, 2018)。药物对性腺分化及发育的影响研究主要包括壬基酚(薛海波, 2010; 李郁娇, 2011;朱春华等, 2017; Guo et al, 2019)、十氯酮(Lafontaine et al, 2016, 2017)及三丁基锡(薛海波, 2010; 李郁娇,2011; 吴维福等, 2013)这三种药物, 以期研究对罗氏沼虾卵黄蛋白原基因表达以及性腺发育的影响。Stalin 等(2019)研究了钴-60 射线对淡水对虾生殖障碍的影响; Tan 等(2019)研究了罗氏沼虾性别逆转与雄激素腺(AG)的关系。罗氏沼虾基因研究……
