李纯璞，张立清，侯存强，李红岩b，于 鑫，张开刚，郭冬梅c*

（1.泰安市中心医院a：骨科；b：麻醉科；c：血液内科；2.泰安市荣军医院；3解放军第960医院泰安院区；4.泰安市中医医院，泰安 271000）

骨肉瘤起源于间充质组织，是儿童和青少年中最常见的原发性恶性骨肿瘤［1,2］。骨肉瘤恶性度高，早期即可发生肺转移，危害性大。当前骨肉瘤的主要治疗方法包括手术、化学疗法和放射治疗［3］。随着治疗的不断改进，骨肉瘤患者5年生存率达到60%～70%，但对于复发、转移和化疗耐药的患者，生存时间明显缩短［4］。已有学者研究发现许多与骨肉瘤进展密切相关的基因，包括 CDC2［5］，ANRIL［6］，HER2和CD44［7］。然而，骨肉瘤发生和发展的分子机制仍不清楚［8-10］。RPUSD1（RNA pseudouridylate synthase domain containing 1）是一个蛋白质编码基因，目前研究显示其在多种肿瘤中发挥重要作用［11-13］。然而，RPUSD1在骨肉瘤发生发展中的作用及其潜在的分子机制尚不清楚。本研究通过Gene Expression Omnibus（GEO）公共数据库，利用生物信息学的方法研究骨肉瘤中基因表达谱芯片数据［14］，分析RPUSD1在骨肉瘤中的表达及对预后的影响，并采用基因集富集分析（gene set enrichment analysis,GSEA）和基因集变异分析（gene set variation analysis,GSVA）方法探索RPUSD1 可能参与的肿瘤相关生物学通路［15，16］，为明确RPUSD1在骨肉瘤中预后预测价值及在骨肉瘤发生发展中的作用奠定基础。

1 材料与方法

1.1 芯片数据

利用美国国立生物技术信息中心（NCBI）的GEO 芯片数据库 （http：//www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/），以“osteosarcoma，Homo”为关键词搜索相关芯片。筛选后，获取3组转录组基因芯片数据：基于GPL13376芯片分析平台（Illumina HumanWG-6 v2.0 expression beadchip）的 GSE28424数据集、基于GPL10295芯片分析平台（Illumina HumanWG-6 v2.0 expression beadchip）的 GSE42352与 GSE21257数据集。GSE28424包括19例骨肉瘤细胞样本和4例正常对照骨样本。……