金堂黑山羊不同组织内参基因筛选与稳定性分析
2021-01-22张楠驰
张楠驰,李 娟,王 利*,魏 勇
(1.西南民族大学青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部和四川省重点实验室,四川 成都 610041;2.四川省畜牧科学研究院动物遗传育种四川省重点实验室,四川 成都 610066;3.阿坝职业学院,四川 阿坝 623200)
金堂黑山羊是我国重要的山羊品种之一,具有体质结实、性成熟早、繁殖力强、多胎性好、生长速度快和抗病能力强等特点。诸多研究者从基因角度对金堂黑山羊生长、免疫和营养等方面进行研究以提高金堂黑山羊肉质和产量。荧光定量PCR(qP⁃CR)技术是基因相关研究中的重要方法之一。为获得较为真实、准确的基因转录情况,在检测目的基因转录水平时需要加入内参基因,因此选择可靠、稳定的内参基因尤为重要。目前在qPCR 的研究中通常使用GAPDH 和ACTB 等基因作为内参基因,但是同一内参基因可能在不同物种、不同组织等情况下转录水平的稳定性存在差异[1]。肽基脯氨酰异构酶B(Peptidylprolyl isomerase B,PPIB)和羟甲基胆汁合酶(Hydroxymethylbilane synthase,HMBS)是分析简阳山羊骨骼肌发育过程中肌内脂肪(Intramuscular fat,IMF)相关基因的最佳内参基因,而18S rRNA 和GAPDH 稳定性相对较差[2]。ACTB 在山羊胃、小肠和卵巢中转录水平的稳定性最佳,18S rRNA 在心和脾中转录水平的稳定性最佳,HMBS 在子宫和肺中转录水平的稳定性最佳[3]。虽然国内外已有关于绵羊和山羊等家畜内参基因筛选的研究,但品种间的差异可能会影响羊亚科内不同品种山羊内参基因的稳定性[4]。目前尚未见金堂黑山羊不同组织内参基因筛选的研究。因此,对金堂黑山羊不同组织内参基因的筛选在提高目的基因在金堂黑山羊不同组织内转录水平研究结果的准确性方面有着重要意义。……
