靶向序列捕获联合高通量测序鉴定成人型多囊肾PKD1基因新突变*
2021-01-16沙艳伟
沙艳伟
厦门大学附属妇女儿童医院/福建省厦门市妇幼保健院男科,福建厦门 361003
常染色体显性遗传性多囊肾病(ADPKD)是最常见的遗传性肾脏疾病,患者多在成年后发病,群体中发病率为1/1 000[1]。ADPKD是由蛋白激酶D1(PKD1)(约85%的病例)或蛋白激酶D2(PKD2)(约15%的病例)突变引起的[2]。PKD1基因定位于16号染色体的短臂上(16p13.3),由51个外显子组成。 cDNA编码区是由12 912个核苷酸(NM_001009944.2)组成,并编码4 303个氨基酸[3]。PKD1基因编码的多囊蛋白-1(PC1)水平降低可导致ADPKD的临床特征[4]。囊肿的发生和扩大是由于管状细胞增殖和凋亡之间的平衡紊乱、膜蛋白细胞极性的改变、细胞外基质缺陷、异常的液体分泌和纤毛功能异常引起的,从而导致肾脏增大、间质纤维化[5]。本研究采用高通量靶向基因捕获测序发现PKD1基因新剪切位点突变,通过家系病史和文献分析,确定PKD1突变为致病基因,现报道如下。
1 资料与方法
1.1一般资料 收集1 个ADPKD家系(图 1)。先证者(Ⅱ1),女,36岁,结婚10年,因其“多囊肾”避孕至今未生育,2019年3月就诊于本科室进行生殖遗传咨询。超声检查提示:肾脏超声可见双肾体积及形态正常,肾实质内出现无数个大小不一的无回声区(图2),最大的为1.6 cm×1.3 cm,集合系统未见异常。先证者父亲因多囊肾导致肾衰竭、尿毒症,已去世。本研究经医院伦理委员会审批通过,患者及家属均已签署知情同意书,在本院行靶向序列捕获联合高通量测序,并进行基因检测和分析。

图1 患者家系图

图2 患者肾脏超声图
1.2方法
1.2.1DNA提取 抽取受试者及对照者静脉血2 mL,按照试剂盒(QIAamp DNA Blood Midi Kit,Qiagen,Hilden,德国)流程提取基因组DNA。……
