储节旺 林浩炜

收稿日期：2020-08-21

基金项目：国家社会科学一般项目“大数据环境下突发事件应急管理情报能力建设研究”（项目编号：16BTQ066）。

作者简介：储节旺（1969-），男，馆长，教授，博士生导师，研究方向：知识管理。林浩炜（1996-），男，硕士研究生，研究方向：知识管理。

摘 要：[目的/意义]旨在深化对国内生物医学数据库的元数据研究，提高国内生物医学数据开放水平。[方法/过程]本文基于基因组学研究人员的元数据功能需求，归纳出结构需求、内容需求、关联需求和使用需求4个维度，提出生物医学元数据功能需求维度模型。通过引入内容结构视图作为分析元数据结构的模型，对国内外生物医学数据库的元数据方案进行比较研究。[结果/结论]国内生物医学数据库可以从数据结构优化、数据质量控制、丰富研究条目和分类汇总链接4个方面推动数据开放的水平。

关键词：生物医学数据;数据开放;元数据;功能需求模型

DOI：10.3969/j.issn.1008-0821.2021.01.001

〔中图分类号〕G203 〔文献标识码〕A 〔文章编号〕1008-0821（2021）01-0004-09

Comparative Studies and Implications of Typical

Biomedical Metadata Functions

Chu Jiewang Lin Haowei

（School of Management，Anhui University，Hefei 230601，China）

Abstract：[Purpose/Significance]This paper aims to make further research on the metadata of domestic biomedical databases and improve the quality of domestic biomedical data opening.[Method/Process]Based on the metadata function requirements of genomics researchers，this paper summarized the four aspects of structure requirements，content requirements，linkage requirements and application requirements，and proposed the SCLA functional requirements dimension model of biomedical metadata.By introducing content structure view as a model for analyzing metadata structure，this paper made a comparative study on the metadata schemes of biomedical databases at home and abroad.[Results/Conclusion]domestic biomedical databases can promote the level of data openness from four aspects：optimization of data structure，data quality control，enrichment of research items and links of subgroups and summaries.

Key words：biomedical data;data opening;metadata;functional requirements model

随着超高通量测序方法在基因学研究领域的应用，研究人员能够更快地获取生物样本的基因组序列数据，大量的原始测序数据被保存到公共数据库中，科研人员获取开放数据和展开研究活动要求相关数据的每条序列记录都可以链接到已测序样本的元数据[1]。生物医学数据库中开放数据的元数据可以描述样本数据集的创建者、时间、位置、机构、上下文、族系等信息，对于查找、检索和重用上传到公共数据库中科学实验结果报告十分重要，当用户查找的科学数据未附带或附带质量较差的元数据时，对实验数据进行索引和利用的软件系统可能无法定位和返回原本符合给定搜索条件的搜索结果[2]。……