基于TCGA数据库构建肝癌Ten-miRNAs风险评估模型及预后分析
2021-01-07陈俊光
生物化工 2020年6期
陈俊光
(石河子大学 生命科学学院,新疆石河子 832003)
肝癌(Liver hepatocellular carcinoma,LIHC)是指发生于肝脏的原发性或者继发性肿瘤。其中,起始于肝脏的癌症称为原发性肝癌,由起始位置不同分为4个类型:肝细胞癌、胆管细胞型肝癌、肝母细胞癌和血管内皮瘤;由血液、淋巴系统转移或者临近肿瘤浸润至肝脏产生的癌症称为继发性肝癌,其患者数量是前者的三十余倍[1-2]。长期慢性炎症、肝硬化和酗酒是导致原发性肝癌的主要因素,此外,代谢症候群和血色沉着病患者等遗传性因素也是肝癌的诱因[3-4]。肝癌患者存在明显的地域分布差异,亚太地区患者数量远高于欧美地区,发病率和肝炎患者数量呈正相关[5-6]。肝癌还存在性别分布差异,男性患者数量高出女性40%,且男性患者死亡率有持续走高趋势,而女性患者死亡率趋势平缓[7]。肝癌是第三大癌症致死类型,患者占所有癌症患者的2.37%,多发现于晚期,死亡率一直居高不下,临床治疗多以侵入式治疗为主。
MicroRNAs(miRNAs),又名小分子核糖核酸,是序列长度21~23 nt的非编码小分子RNA,经DNA转录后并未进一步翻译成蛋白质,而是和mRNA的3'UTR部分或者完全互补配对结合,从而调控基因表达在细胞凋亡、分化和增殖上发挥着重要作用[8-9]。miRNAs在体内发挥着类似抑癌基因和原癌基因的功能,但在肿瘤中常处于失调状态,因此miRNAs的异常水平表达和癌症的发展以及预后密切相关[10-11]。miRNAs不仅可以作为精确预测、诊断和追踪癌症预后的生物标志物,而且在肿瘤的靶向药物开发和化疗方案选取上具有重要的参考价值。……
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