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f101基因3’端非翻译区微小RNA结合位点单核苷酸多态性与非霍奇金淋巴瘤患者预后的关系

2020-12-25

中国医科大学学报 2020年12期
关键词:淋巴瘤多态性基因型

(河北医科大学第四医院血液科,石家庄 050000)

非霍奇金淋巴瘤(non-Hodgkin lymphoma,NHL)是全世界第五大最常见癌症相关死亡病因[1],造成全球约20万的年死亡病例[2]。美国癌症登记处指出,NHL的发病率在过去的几十年中呈倍数增长趋势[3]。NHL是以B或T和NK淋巴细胞单克隆增殖为特点的一组异质性免疫系统肿瘤[4-5]。以往研究[6-8]表明,不同亚型的NHL生存模式不同,而且有不同的预后危险因素。国际预后指数(international prognostic index,IPI)模型1993年被应用于侵袭性NHL患者的预后预测,在IPI模型中临床特征对于预后至关重要[9]。但IPI评分一样的患者也可能显示不同的生存和预后。研究[10]发现遗传因素可以预测NHL的生存和预后。微小RNA(microRNA,miRNA)参与多种生物活动包括发育、分化、凋亡、生存、衰老、翻译抑制,并促进信使RNA的降解和代谢[11-12]。miRNA在肿瘤中扩增或过表达,通过结合靶基因3’端非翻译区(3’ untranslated regions,3’-UTRs)的互补序列沉默靶基因从而促进肿瘤发展[13]。在3’-UTRs靶位点的基因多态性改变miRNA和靶基因之间亲和力,从而影响靶基因的表达并修改致癌作用[14]。然而,迄今为止miRNA相关单核苷酸多态性(miRNA related single nucleotide polymorphism,miRSNPs)和NHL的研究报告很少。本研究中选择f101 rs4901706来评估其对NHL癌症风险和预后的作用。

1 材料与方法

1.1 标本来源

选取2006年1月1日至2015年10月1日于河北医科大学第四医院血液科治疗的258例患者作为病例组。所有患者均来自中国北方地区。其中,男152例,女106例,年龄14~87岁,中位年龄为50岁。将患者按照造血与淋巴组织肿瘤WHO分类:(1)惰性淋巴瘤(50例),包括黏膜相关淋巴组织类型淋巴瘤、滤泡淋巴瘤、淋巴浆细胞淋巴瘤,小淋巴细胞性淋巴瘤/慢性淋巴细胞白血病和T大颗粒淋巴细胞白血病;(2)侵袭性淋巴瘤(165例),包括弥漫型大B细胞淋巴瘤,套细胞淋巴瘤,外周T细胞淋巴瘤,间变性大细胞淋巴瘤,血管免疫母T细胞淋巴瘤;(3)高度侵略性淋巴瘤(32例),包括T和B 淋巴母细胞白血病,鼻腔NK/T细胞淋巴瘤,伯基特淋巴瘤。其余11例患者为不明亚型。选取2011年1月1日至2016年1月1日于河北医科大学第四医院健康体检者110例作为对照。本研究获得河北医科大学第四医院伦理委员会批准(2016MEC066),所有参与者均知情同意。

1.2 DNA提取和f101基因分型

基因组DNA应用向导基因组DNA提取工具提取。miRNA结合位点f101(rs4901706)的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)应用连接酶检测反应方法进行基因分型。引物序列为F:5’-AA ACTAAGTCATCTCCCAGATA-3’;R:5’-GTCATCTG GTGAAAGACTGGA-3’。扩增DNA片段根据NCBI数据库(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp)。聚合酶链反应应用PCR混合试剂盒按照制造商的说明进行(Promega)。DNA产品应用ABI 3730XL基因分析仪分离。连接用探针为S1(5’-TTTTTTTTTTAATGGGG TATTCAGTGACTAAGA-3’),S2(5’-TTTTTTTTTTTT TAATGGGGTATTCAGTGACTAAGG-3’),S3(5’-TCT GCTATTTATGCAAAATTCTGTTTTTTTT-3’)。多态性被证实基于rs4901706不同等位基因的长度差异。

1.3 统计学分析

采用SPSS 18.0软件包进行统计分析。应用logrank检验及Kaplan-Meier法计算3年总生存率。多因素生存分析采用Cox比例风险模型。P<0.05为差异有统计学意义。

2 结果

2.1 随访结果

258例患者的随访时间为10~36个月,随访率为100%。期间169例患者死亡,死亡原因分别为疾病进展(121例)、感染(25例)、出血(9例)和其他(14例)。3年生存率为34.5%(89/258)。

2.2 临床病理特征与NHL患者生存率之间的关系

单因素分析结果显示,B细胞型患者高于T细胞型患者(P=0.005);骨髓非浸润患者高于骨髓浸润患者(P=0.001);无B症状患者高于有B症状患者(P=0.001);乳酸脱氢酶(lactic dehydrogenase,LDH)水平正常患者高于LDH水平偏高患者(P<0.001);肿瘤惰性患者高于侵袭性和高度侵袭性患者(P均<0.05),肿瘤侵袭性患者高于高度侵袭性患者(P=0.023);Ann Arbor分期为Ⅰ、Ⅱ期的患者高于分期为Ⅲ、Ⅳ期的患者(P<0.001);原发部位为结外和淋巴结的患者高于原发病为白血病的患者(P<0.001);IPI评分为低危的患者高于低中危、中高危和高危的患者(P均<0.05);T细胞亚型为AA型的患者高于AG/GG型患者(P=0.025),见表1。

2.3 f101基因型的分布及其与NHL患者生存率之间的关系

f101基因型与NHL患者临床特征(Ann Arbor分期、LDH水平、IPI评分、肿瘤侵袭性)的相关性通过χ2检验进行评估,未发现相关性,见表2。f101基因型为AA型的患者27例(10.5%),AG/GG基因型的患者为231例(89.5%)。f101基因型为AA型患者的3年生存率高于基因型为AG/GG型的患者(P=0.017),见图1。

2.4 NHL患者f101基因型及临床病理特征与患者生存率之间的关系

将上述单因素纳入多因素Cox比例风险回归模型分析显示,f101AG/GG基因型可作为NHL患者的独立预后指标,与患者的生存率(RR:1.768,95%CI:1.045~2.997,P=0.035)密切相关;同时患者的年龄、侵袭性、原发部位和IPI评分也与患者生存率密切相关(P<0.05),见表3。

表1 单因素分析NHL患者的临床特点与生存率相关性Tab.1 Univariate analysis of the correlation between clinical features and survival rate in NHL patients

3 讨论

本研究对258例NHL患者选择f101基因rs4901706位点的miR-SNP进行分析,评估其与NHL癌症风险和预后的相关性。结果发现rs4901706基因多态性与NHL癌症风险无关。f101rs4901706AA基因型患者的生存时间比AG/GG基因型更长。多因素分析表明,f101rs4901706AA基因型是NHL生存的一个独立预后变量。结果同样适用于TCL亚组。

miRNA途径已成为调控肿瘤发生的关键系统。miRNA途径相关的SNP,被称为miR-SNPs,依据其位置以不同的方式调节miRNA的功能,可以直接影响miRNA的表达水平或影响miRNA与目标的相互作用[15]。研究miR-SNPs可以打开新的癌症生物学和临床肿瘤学研究领域,尤其是在危险分层、对治疗的反应等[16]。BRADSHAW等[17]首次报道MIR143中的miRSNP与高加索人的NHL风险降低相关。PECKHAM-GREGORY等[18]研究表明,一些miRNASNP与AIDS-NHL风险有关,并可能调节miRNA的表达。FU等[19]发现miR-618参与滤泡性淋巴瘤的发生,确定miR-618是滤泡性淋巴瘤的潜在危险生物标志物,并阐明了miR-618调控的淋巴瘤发生途径。本研究评估rs4901706SNP对NHL癌症风险的预测能力,结果显示两者没有关联。YU等[20]使用许多类型的

癌症作为一个整体研究对象,确定rs4901706SNP与癌症风险有关,说明miRSNP癌症风险相关性趋势可能存在于某些特定的癌症患者。研究发现rs4901706的等位基因A与某些特定癌症风险相关,而本课题组前期研究发现该等位基因A提示NHL患者预后良好,说明参与NHL病因的miRNA-SNP未必影响患者预后,而影响预后的miRNA-SNP 未必参与其中。

表2 χ2检验单因素分析临床特征与f101相关性Tab.2 Correlation between clinical features and f101 using χ2 test

表3 多因素分析f101基因型和临床特点与NHL生存相关性Tab.3 Multivariate analysis of the relationship between the f101 genotype and cumulative survival of NHL patients

图1 rs4901706基因型与TCL生存相关性Fig.1 Correlation between the rs4901706 genotype and survival of TCL patients

本研究结果显示,miRNA结合位点SNP影响癌症总生存。f101的3’端非翻译区rs4901706SNP改变了其与miRNA的亲和力,从而影响它的表达;rs4901706A→G过渡可能破坏miRNA结合位点的A:T键,调整f101表达。然而,本研究的结果还需要进一步验证。

总之,miRNA结合位点f101的SNP被发现是NHL总体生存的一个独立预后标志。miRNA结合位点的基因多态性分析可能有助于识别患者预后较差的亚组,从而为NHL患者制定治疗方案提供依据。

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