基于公共数据库分析PEG3基因在肺腺癌中的表达及预后意义

2020-09-21

中国医科大学学报 2020年9期

（中国医科大学附属第一医院放疗科，沈阳 110001）

近年来，肺癌的发病率及死亡率均呈逐渐上升趋势，是癌症死亡的首要原因。非小细胞肺癌（nonsmall cell lung cancer，NSCLC）约占肺癌的80%左右，其中腺癌是NSCLC中常见的病理类型，早期易发生血行转移，尽管目前针对肺腺癌的治疗手段较多，但其5年生存率仍不理想［1］。

PEG3基因编码kruppel C2H2型锌指蛋白，其转录本可编码1572个氨基酸序列［2］。PEG3蛋白参与Wnt［3］、p53［4］、NF-κB［5］等多条信号通路，调控调亡［4］、自噬［6］等重要生物学过程，在肿瘤研究中PEG3基因作为抑癌基因，被证实在子宫颈癌［7］及胶质瘤［3］中能抑制肿瘤的生长。

PEG3作为人类的印迹基因，位于染色体19q13.43上［2］。由于PEG3基因包含一些非编码区域，目前有多个研究［8-9］探讨了与PEG3相关的非编码RNA。但PEG3在肺腺癌中是否发挥作用，及其与肺腺癌发生、发展的关系，目前尚无相关研究。本研究通过公共数据库分析PEG3基因在肺腺癌中的表达及其对预后的影响，为进一步研究PEG3在肺腺癌发生发展过程中的作用奠定了基础。

1 材料与方法

1.1 TIMER和人类蛋白质图谱数据库

应用TIMER 数据库［10］（www.cistrome.shinyapps.io/timer）分析PEG3在TCGA肺腺癌数据库中的mRNA表达情况。人类蛋白质表达图谱（THE HUMAN PROTEIN ATLAS，www.proteinatlas.org）分析PEG3在肺癌TCGA数据库中的预后情况。