广东地区8 株鹅源基因XII 型新城疫病毒F 蛋白基因遗传进化分析
2020-08-06王杰煌朱婉君伍辉吉钟嘉诚张溢珊刘英慧张济培陈济铛
王杰煌,朱婉君,伍辉吉,钟嘉诚,张溢珊,王 贺,刘英慧,张济培,,陈济铛,*
(1. 佛山科学技术学院,广东 佛山 528225;2. 万牧洲生物科技有限公司,广东 佛山 528225)
新城疫(Newcastle disease,ND)是由ND 病毒(NDV)感染禽类引起的一种高发病率、高死亡率的急性烈性传染病[1]。NDV 分为class I 和class II 两种谱系,每一类可再分为多个基因型和基因亚型,其中,class II 至少包括18 个基因型(I-XVIII)[2]。1990 年以来,中国主要流行的是以ZJ1 株为代表株的基因VIId 亚型NDV[3-4],该亚型病毒感染家养水禽特别是鹅后呈高发病率和高死亡率特征,给我国水禽养殖业带来重大的经济损失。近年,国内禽源NDV 开始出现新的基因型和基因亚型,如2010 年,在广东活禽市场首次监测到基因XII 型NDV,随后在广东、福建等地多次分离得到该基因型病毒[5-6]。国际上,2004 年秘鲁鸡中首次发现基因XII 型NDV,随后在哥伦比亚、越南等地也陆续出现XII 型NDV感染鸡群的报道[7-8]。目前,我国XII 型分离株均属XIIb 亚型,与上述国家分离到的XIIa和XIId亚型差异较大[5-9]。本研究从广东临床呈典型NDV 感染的病死鹅中分离鉴定得到8株XII型NDV,并对这8株NDV的F基因序列进行同源性和遗传进化分析,并对其F 蛋白氨基酸序列进行分析,为进一步了解广东地区鹅源XII 型NDV 遗传进化、分子流行病学及疫苗株筛选提供参考。
1 材料与方法
1.1 病料来源临床样品采集自广东地区表现疑似新城疫临床症状的病死鹅,采集病料种类包括肝、脾、胰、脑共45份。各病毒株具体信息见表1。

表1 NDV 分离株信息表Table 1 Information of the eight NDV isolates
1.2 主要试剂DL2000 Marker、ExTaq 酶、LaTaq酶、反转录试剂盒(Prime-ScriptTMⅡ1st Strand cDNA Synthesis Kit)、 随 机 引 物(Random primer)、pMD18-T 克隆载体、大肠杆菌DH5α感受态细胞均购自TaKaRa 公司;……
