白秀娟，姜恩泽，苏 杭，朱宇航，许 愿，徐逸男，李 雪，韩志强，徐 超

（1.东北农业大学动物科学技术学院，哈尔滨，150030；2.中国农业科学院特产研究所，长春 130112）

KIT基因，又名c-KIT基因，编码的肥大/干细胞生长因子受体（Mast/stem cell growth factor receptors）最初于猫肉瘤病毒中被发现[1]。在色素沉着方面，KIT基因主要调控黑色素细胞前体沿特定路径迁移到真皮、表皮、内耳和眼脉络膜的过程[2]。KIT基因非正常编码或表达量较少时，黑色素细胞不会正常增殖和迁移，机体产生不同程度白化[3]。白癜风患者KIT基因表达量极显著低于正常人[4]。目前，KIT基因在动物中已发现多种突变体。狐狸白色被毛与KIT基因外显子12缺失有关[5]。KIT基因易位使牛表现不同程度白斑[6]。阿拉伯骆驼白色斑点与KIT基因突变有关[7]。研究表明KIT基因在毛色调控中发挥重要作用。

乌苏里貉（Nyctereutes procyonoides）属于犬科（Canidae），经济价值较高的毛皮动物。研究表明野猪KIT基因与毛色表型不相关[8]，乌苏里貉KIT基因编码区未发现与毛色相关单核苷酸位点[9-10]，乌苏里貉KIT基因与毛色关系未见报道，为了解乌苏里貉KIT基因及编码蛋白结构特性，基于机器学习和人工神经网络等在线软件对其编码蛋白一级、二级、三级结构作全面生物信息学分析。研究结果旨在比较乌苏里貉与其他动物KIT基因提供参考，为了解KIT基因潜在功能提供新思路。

1 材料与方法

1.1 KIT基因转录本定量

根据中国农业科学院特产研究所上传到SRA数据库的乌苏里貉皮肤转录组数据:野生貉（SRS1620675，SRS1620679，SRS1620678），白貉（SRR4158185，SRR4158184，SRR4158183），红棕貉（SRR4034955， SRR4034954，SRR4034953）各3只，原始数据均由Illumina HiSeqTM 2000双端测序获得，按文献[11]方法分析转录本数据。……