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胃癌中异常表达剪接因子的生物信息学分析及功能

2020-07-09张爱东

中国医学科学院学报 2020年3期
关键词:胃癌差异研究

张爱东,史 娟

中国医学科学院 北京协和医学院 基础医学研究所医学分子生物学国家重点实验室,北京 100005

胃癌作为一种常见的消化系统恶性肿瘤之一,死亡率一直居高不下。据调查,胃癌发病率在中国所有癌症中居第2位,在全世界的发病率居第5位,致死率在所有肿瘤中居第3位[1]。胃癌患者的年龄主要集中在40~70岁,其他年龄段患者人数较少,但近年来青年人的胃癌发病率呈上升趋势[2]。早期胃癌患者行根治性切除术后的5年生存率可达90%,但是由于早期诊断中缺少有效的分子标志物等原因,我国胃癌患者就诊时约80%已到晚期,导致疾病进一步发展、肿瘤转移,甚至步入终末期[3]。

选择性剪接的发生与细胞的生理病理、发育调控甚至疾病的发生有关[4]。有研究表明,在癌症发生发展过程中,选择性剪切的发生以及在这个过程中产生的异构体蛋白的功能,对癌症的诊断和治疗都具有非常重要的意义[5]。选择性剪接对癌基因以及抑癌基因的活性和异常表达均有调控作用,从而对癌症的发生及恶化产生一定影响。研究还表明,选择性剪接可以影响蛋白质结构域家族,这些蛋白质家族在肿瘤中经常发生突变并可能破坏癌症相关途径中的蛋白质-蛋白质相互作用,该发现为癌症的治疗提供了新思路[6]。富含丝氨酸苏氨酸蛋白家族(SR)是选择性剪接调节的重要因子之一,有多个拷贝的RNA识别基序(RNA recognition motif,RRM)。富含丝氨酸苏氨酸蛋白家族中的剪接因子10(SR Splicing Factor,SRSF10)基因作为SR蛋白家族中重要的成员之一,具有经典的SR蛋白结构域,是一个重要的剪切因子。……

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