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红树林土壤环境DNA提取和纯化方法比较*

2020-06-02朱旭瑶杨明柳潘红平

广西科学 2020年1期
关键词:红树林方法

朱旭瑶,杨明柳,潘红平,阎 冰,廖 馨**

(1.广西大学动物科学技术学院,广西南宁 530004;2.广西科学院广西红树林研究中心,广西红树林保护与利用重点实验室,广西北海 536000)

0 引言

红树林研究具有重要的理论意义和现实经济意义,近年来围填海是广西乃至我国红树林面积减少的最直接原因,由于大量的围垦造田、围海养殖和道路码头的修建,大量红树林受到破坏[1-2],严重威胁到海岸生物的多样性。对红树林生态系统的生物多样性进行持续性监测,是针对性制定和实施生态系统保护策略和合理有效利用资源的基本前提。红树林的种类组成和群落结构比陆地森林简单得多,但它有丰富的形态结构和地面微景观地貌,这些细化的生境对生物多样性的丰富至关重要[3]。目前,对红树林生物多样性的调查和研究主要采用传统的生态学调查方法,传统的调查方法费时费力且存在着诸多缺点,在分子生物学高速发展的今天,急需对传统的生物多样性调查方法作出改变。

环境DNA(Environmental DNA,eDNA)的概念于20世纪80年代末首次被提出,是指不对目标生物进行分离,而直接从环境样品(比如土壤、沉积物、空气、水体等)中提取的DNA[4]。环境DNA提取技术最早出现在环境微生物学领域,被用来分离和纯化沉积物中微生物的DNA。近年来,环境DNA技术被应用在生物多样性分析、生物量估测、珍稀物种发现、生物入侵物种的监控、隐存种的发现、群落系统发育重建、物种间食物链关系分析等生态学研究领域[5-8]。……

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