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基于转录组数据的青蛤微卫星标记开发与验证

2020-05-22沈彦鹏张雷雷李腾腾邵艳卿

应用海洋学学报 2020年2期

方 军,沈彦鹏,张雷雷,李腾腾,邵艳卿*

(1.浙江省海洋水产养殖研究所、浙江省近岸水域生物资源开发与保护重点实验室、 中国水产科学研究院海洋贝类工程技术研究中心,浙江 温州 325005; 2.温州医科大学,浙江 温州 325016)

青蛤(Cyclinasinensis) 俗称环文蛤,隶属双壳纲、帘蛤目、帘蛤科,是我国一种重要养殖经济贝类。随着青蛤养殖方式多样化、养殖技术不断成熟,越来越多育种群体及家系被培育出来,为了避免由于常年人工养殖导致遗传结构单一,同时也为保护青蛤自然种群不被人工多代繁育的养殖群体所污染,需要通过有效的分子手段评价种质资源和遗传多样性。然而有关青蛤微卫星标记十分有限,仅见董志国等(2011)通过磁珠富集法从基因组中开发SSR标记的报道[1]。目前迫切需要开发具有共显性遗传、多态性丰富、易于规模化检测、检测成本低等优势的分子标记,以开展青蛤种群遗传多样性分析、遗传育种等研究。

在众多水生生物分子标记中,微卫星标记又称简单序列重复(Simple Sequence Repeat, SSR),由1~6个核苷酸串联重复片段构成,与其他分子标记相比,具有共显性遗传、高度多态杂合且稳定性好、易操作、检测成本低等优点,目前已广泛应用于系谱分析、遗传图谱构建、遗传多样性研究等多项领域。李炼星(2017)通过对选育的缢蛏(Sinonovaculaconstricta)后代进行微卫星分析[2],结果表明连续6代在亲本间有近亲关系或者亲本数量有限情况下,人工选育缢蛏苗种遗传多样性显示明显降低。连续累代群体选育工作使得缢蛏选育系的遗传特性纯化,可为后续选育工作中通过不同种群、家系间杂交或者增加亲本数量来提高遗传多样性和生长性状、耐病性、适应环境变化等目标性状;……

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