庞文玉 王安 杨宝谊

摘要：核苷转运蛋白（nucleoside transporter，ENT）是一类具有跨膜运输核苷和核苷类似物的功能蛋白。为深入研究大白菜ENT基因家族的功能，利用生物信息学方法对大白菜基因组中的ENT基因家族成员进行鉴定，并对其基因组信息、蛋白生理生化特征、基因结构、保守结构域、系统进化树等方面进行了研究。结果表明，在大白菜基因组中共鉴定到12个ENT基因，通过系统发育树分析，可以将12个ENT基因分为2类;对大白菜ENT蛋白氨基酸序列多重比对和蛋白跨膜域的分析表明，BrENT蛋白存在11个跨膜域，为跨膜蛋白;通过MEME软件对大白菜ENT蛋白motif的预测还发现了14个比较保守的motif。染色体分析表明，ENT基因在大白菜10条染色体上不均匀分布，而且存在明显的串联重复现象，推测串联复制是ENT基因家族基因扩增的主要方式，研究结果为在基因组范围内研究ENT基因的功能奠定了基础。

关键词：大白菜;核苷转运蛋白;基因家族;生物信息学

中图分类号： S634.101  文献标志码： A  文章编号：1002-1302（2019）12-0052-05

核苷转运蛋白是一类具有跨膜运输核苷和核苷类似物的功能蛋白，被转运的核苷在核苷酸合成代谢的补救途径中发挥重要作用。核苷转运蛋白可分为扩散型的核苷转运蛋白（equilibrative nucleoside transporter，ENT）和富集型的核苷转运蛋白（concentrative nucleoside transported，CNT）2种类型。其中ENT在生物体内的分布非常广泛，ENT家族被克隆的首个成员是hENT1，其cDNA是1996年从人胎盘中克隆得到的[1]。目前，在哺乳动物、细菌、酵母、寄生虫和植物中均发现并鉴定到了ENT[2]。由于核苷转运蛋白与癌症、神经和心血管病的治疗，寄生虫病的防治以及抗病毒、人体保健等方面密切相关，因此在动物中得到深入而广泛的研究[3-4]。……