基于磁珠的核酸快速提取和纯化
2019-08-21张翠真袁小龙陈志和毛振方简少卿赵大显
张翠真, 袁小龙, 陈志和, 毛振方, 简少卿,2, 赵大显,2
(1. 南昌大学 生命科学学院, 南昌 330031; 2. 江西省水产动物资源与利用重点实验室, 南昌 330031)
核酸的分子生物学技术是进行病原微生物检测、物种鉴定、物种起源、多样性评估及其亲缘关系、系统进化等常用研究手段之一。能否提取出高质量的核酸则是分子生物学实验中的关键,提取方法的灵敏度、特异性也将直接关系到后续试验的成败。因此,核酸提取是分子生物学最关键的方法之一[1]。
随着分子生物学的广泛应用,对核酸提取技术也提出了新的要求,高效、便捷、环保、大通量、自动化成为核酸提取技术发展的主流方向。从第1代化学法[2-6],如酚-氯仿法、Trizol法,到第2代吸附柱法[2],以及近年发展起来的第3代磁珠法[7-11],其提取技术和效率不断地改进优化。
本研究通过纳米磁珠法提取纯化细菌基因组DNA、总RNA和质粒DNA,并与试剂盒法和Trizol法提取效果进行比对分析,以期获得最佳的提取方法,为核酸提取技术提供理论数据。
1 材料与方法
1.1 材料
SanPrep柱式质粒DNA小量抽提试剂盒、SanPrep柱式DNA胶回收试剂盒、SanPrep柱式PCR产物纯化试剂盒购自上海生工,Universal Genomic DNA Extraction Kit购自Takara,Trizol试剂购自ABI。细菌 RNAOμT购自北京天恩泽基因科技有限公司。
PCR所需引物序列上游(5′-CAATATCAGCGATGCCGAACGTAT-3′)和下游引物(5′-TACCATCACCTACCACCGAGATAA-3′)均由上海生工合成。
1.2 方法
1.2.1 细菌基因组DNA提取
试剂盒法按照Universal Genomic DNA Extraction Kit说明书要求操作。
纳米磁珠法提取大肠杆菌基因组DNA:取2 mL大肠杆菌DH10B(E.coliDH10B)培养液,9000 r/min离心,加入500 μL Lysis buffer II,混匀,室温裂解5 min,加入200 μL氯仿/异戊醇(24∶ 1),振荡30 s,13 000 r/min离心5 min;取200 μL上清液加入200 μL磁珠悬液,振荡混匀,室温吸附5 min,静置 20 s,吸出上清液;……
