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宏基因组测序分析男性运动员肠道菌群物种组成及代谢通路特点

2019-08-21金泽宇李威孙宝林

生物学杂志 2019年4期
关键词:物种差异学生

金泽宇, 李威, 孙宝林

(中国科学技术大学 先进技术研究院卓源健康人体微生物组研究联合实验室, 合肥 230088)

定植在人体内细菌的数量至少与人体体细胞数相同,而人体微生物编码的基因数量则远超人体基因组[1]。据估计有500~1000种细菌同时存在于人体内,其中的亚种数目更是超过这一数量级[2]。每株细菌的基因组包含上千种基因,提供了丰富的基因多样性,从而使人体微生物组具备了更强的适应性[3-4]。肠道是人体菌群定植的主要部位,肠道菌群可以参与宿主代谢[5]、抑制病原微生物生长[6]等多种生理过程。不同的人群由于受其基因型[7]、饮食[8-9]和健康状况[10]等不同因素的影响,肠道菌群的组成具有很大差别。目前虽有一些针对特定人群的肠道菌群研究,但多为按照年龄[11]、地区[12]或是疾病类型[13-14]来进行划分,运动员群体具有生活饮食规律、运动训练时间充足的特点,其肠道菌群的特征能够在一定程度上反映规律的生活饮食和充分的运动训练对肠道菌群的影响。本研究选取男性田径运动员的肠道菌群样本进行研究,其每日饮食标准如下:热能3500~4500 kCal,蛋白质80~120 g,脂肪80~120 g,碳水化合物615~735 g,钙600 mg,磷1000 mg,铁12 mg,维生素A 1000 μg视黄醇当量,维生素B12 mg,维生素B22 mg,烟酸20 mg,维生素C 100 mg。采集其肠道微生物样本后使用Illumina HiSeq平台进行宏基因组测序,同时为排除性别对肠道菌群的影响,以相同地区同等年龄的普通男性大学生肠道菌群作为对照,在不同分类水平上对男性运动员的肠道菌群结构进行分析,并寻找其代谢通路相比对照组发生的改变,为男性运动员肠道菌群的物种组成及功能研究提供了参考。……

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