基于生物信息学的乳腺癌治疗药物的筛选及其分子机制研究
2019-05-21廖思帆吴丽媛梁碧怡李焕丹周漩
广东药科大学学报 2019年2期
廖思帆,吴丽媛,梁碧怡,李焕丹,周漩
(广东药科大学药学院,广东 广州 510006)
乳腺癌是女性常见的恶性肿瘤之一,发病率和死亡率居妇女各类恶性肿瘤之首,严重威胁着女性的身体健康[1]。近年来乳腺癌的治疗手段不断发展,手术治疗、化学治疗、靶向治疗等多种临床治疗手段已经日趋成熟,但由于乳腺癌本身具有高度异质性[2]及易转移性等特点,乳腺癌患者的死亡率仍然得不到有效的控制。因此,筛选更有效的乳腺癌治疗药物,延长病人的生存期和降低乳腺癌的死亡率,具有重要意义。
传统的药物研发是一个复杂而漫长的过程,需要耗费大量的人力物力,才能找到较为行之有效的候选药物。基因表达谱芯片可以同时观察成千上万个基因在不同个体、不同组织、不同发育阶段的表达状况[3],根据基因在不同条件下的表达差异性来进行药物筛选,可为药物研发提供方向,加快药物的发现。
因此,本文采用生物信息学方法对乳腺癌相关基因表达谱数据进行挖掘分析,筛选乳腺癌候选治疗药物,并对筛选得到的候选药物进行生物学通路、作用靶点等分析,研究其分子机制,加快乳腺癌药物研发的进程,为乳腺癌临床治疗研究提供理论参考。
1 数据集
本文研究所用的乳腺癌基因表达谱数据来自于NCBI的GEO数据库(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ geo/)的GPL570平台,包括GSE29044、GSE42568、GSE9309和GSE50428。其中,GSE29044包括73个乳腺癌组织与36个正常乳腺组织,共109个样本;GSE42568包括104个乳腺癌组织与17个正常乳腺组织,共121个样本;GSE9309包括128个乳腺癌组织与9个正常乳腺组织,共137个样本;……
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