百草枯核酸适配体的筛选及其比色检测研究
2019-05-13冉旭东吴远根
分析化学 2019年4期
冉旭东 吴远根
摘 要 核酸适配体具有类似蛋白抗体的性质,在靶标特异性识别与检测中引起越来越广泛的关注。小分子物质通常与环境污染和人类健康密切相关,然而小分子物质与核酸文库在性质上差异较小,在筛选过程中没有足够的活性位点,难以固定,因而其核酸适配体筛选难度更大。本研究采用体外合成一条生物素修饰的碱基序列,通过氢键与随机文库3′-末端进行互补配对,将其固定在链霉亲和素修饰的纳米磁珠上。随后,加入不同浓度的百草枯靶分子孵育,洗脱得到百草枯特异性的亲和性ssDNA,对其进行非对称PCR扩增后,得到下一轮筛选所需的富集ssDNA库。经过9轮筛选后,将所得亲和性ssDNA进行克隆测序,最终得到15条百草枯的亲和ssDNA序列。对亲和性序列进行聚类分析和二级结构预测,再根据同源性等条件从中筛选出6条ssDNA序列进行亲和力测定。结果表明,PQ-15序列对百草枯的亲和力最高,解离常数(Kd)为(54±4) nmol/L。最后,利用PQ-15核酸适配体作为百草枯的识别分子,以阳离子化合物聚集的纳米金作为传感信号,建立了基于核酸适配体识别的百草枯农药比色检测方法,检出限为25.2 nmol/L,其它竞争性分子对百草枯检测无明显干扰,实际样品中百草枯的加标回收率为91.1%~99.6%。
关键词 核酸适配体; 百草枯; 筛选; 比色检测; 纳米金
1 引 言
百草枯(1,1-二甲基-4,4-二吡啶二氯)是一种具有双苯环结构、极性很强的有机小分子,是毒性最强的除草剂之一,在水中溶解度极高[1]。由于生产成本较低、除草效率高,因而被广泛应用于农业生产,曾在一些发展中国家广泛使用[2]。……
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