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废弃毕赤酵母核糖核酸提取条件的优化

2019-05-13卜光明杨海龙

浙江化工 2019年4期
关键词:酵母核酸条件

卜光明, 颜 茜, 杨海龙*

(1.浙江瑞邦药业股份有限公司,浙江 温州 325000;2.温州大学生命与环境科学学院,浙江 温州 325035)

核糖核酸(ribonucleicacid,RNA)是生物体内的高分子化合物,对维持机体的正常功能有重要作用,是特定生理条件下不可缺少的营养成分。外源性核糖核酸在机体营养、免疫调节和疾病防治等方面都有一定的功能,核酸类物质可以作为营养保健食品的添加剂,对促进儿童的生长发育、减缓老年人的衰老和病后虚弱身体的康复均有一定效果;在农牧渔业中,核酸类物质可以用作植物生长刺激剂和饲料添加剂[1-2]。

酵母中RNA含量高,适合于工业化生产,如利用酿酒酵母、产朊假丝酵母等微生物发酵制备[3-4];同时,采用啤酒酿造产生的废弃酵母等原料提取也是获得RNA的重要途径[5-6]。甲醇营养型毕赤酵母(Pichia pastoris)是能够利用甲醇作为唯一碳源和能源的酵母菌,作为一类优秀的表达系统,除了具有蛋白质的加工和折叠等真核表达系统所共有的优点外,还兼具诸如大肠杆菌等微生物的易于操作的特点;与动物细胞等真核表达系统相比,它具有简便、快捷、成本低、表达水平较高等优点。毕赤酵母表达系统已被广泛应用于植酸酶、木聚糖酶、白蛋白等产品生产基因工程菌的构建[7-10],并实现了这些产品的工业化生产。在生产过程中会产生大量的毕赤酵母菌体,如不加以处理不仅会造成资源浪费,还会导致严重的环境污染[11]。为实现废弃资源的综合利用,本文研究了从废弃毕赤酵母提取核糖核酸的工艺条件。

1 材料与方法

1.1 试验材料

废弃毕赤酵母:为植酸酶毕赤酵母基因工程菌发酵副产物,由北京中农博特生物工程技术有限公司提供。

1.2 试验方法

1.2.1 毕赤酵母核糖核酸的提取

提取工艺:取废毕赤酵母泥→按其干重配成一定浓度的悬浮液100 mL→加入一定浓度的氢氧化钠调节其pH值→在一定温度下保温提取一定时间→离心→弃去残渣→上清液调节pH至等电点→过夜沉淀→离心取沉淀→核糖核酸→干燥后称重。

1.2.2 毕赤酵母核糖核酸含量的测定[6]

采用紫外分光光度法测定,取一定量的RNA样品,用水定容至100 mL,经适当稀释后分别测定吸光值A260和A280,并计算A260/A280判断所提取核糖核酸样品的纯度。由以下公式计算核糖核酸的提取率:

式中:A260为样品波长260 nm处的吸光度值;100为样品定容的体积;N为稀释倍数;m为称取的 RNA样品重量 (g);106为 μg转换为 g;0.024 为 1 μg/mL RNA 的 A260。

1.2.3 毕赤酵母核糖核酸提取条件优化的试验设计

影响毕赤酵母核糖核酸提取的因素有很多,本文利用正交试验设计研究溶液pH值、提取温度、提取时间、毕赤酵母浓度对核糖核酸提取的影响。根据单因素试验结果,设计四因素三个水平正交试验,如表1。

表1 L9(34)正交实验因素水平表Table 1 Factors table of orthogonal test

2 结果与讨论

2.1 pH值对核糖核酸提取的影响

配置10%浓度的毕赤酵母溶液100 mL,分别调 pH 至 7、8、9、10、11, 于 85 ℃下抽提 1.5 h,离心取上清液,调至核酸等电点(pH=2.5),过夜沉淀得到RNA,结果见图1。由图1可知,核糖核酸的提取率随pH值的增大而增大,pH为9时提取率达到1.74%。而在啤酒酵母的提取中,pH=7.5时,核糖核酸的提取率和纯度达到最大[12],且随着pH值的增大,提取率逐渐减少。啤酒酵母和毕赤酵母的细胞壁结构成分上存在一定的差异,pH较大的情况下对毕赤酵母细胞壁的作用更好,使其具有较好的通透性。因此,可以选择pH=9进行下面的试验。

图1 pH值对RNA提取率的影响Fig.1 The effects of pH on the extraction of RNA

2.2 提取温度对碱法核酸提取的影响

配置10%浓度的毕赤酵母溶液100 mL,调pH至9,分别置于55℃、65℃、75℃、85℃、95℃下抽提1.5 h,离心取上清液,调至核酸等电点,过夜沉淀获得RNA,结果见图2。由图2可知,温度越高,促进了碱对毕赤酵母细胞壁的作用,使核糖核酸释放得越多,核糖核酸的提取量随温度的升高而增大,温度95℃时提取量达到1.85%。

图2 提取温度对RNA提取率的影响Fig.2 The effects of temperature on the extraction of RNA

2.3 提取时间对碱法核酸提取的影响

配置10%浓度的毕赤酵母溶液100 mL,调pH 至9置于 95℃下,分别提取 0.5 h、1 h、1.5 h、2 h、2.5 h、3 h,离心取上清液,调至核酸等电点,过夜沉淀获得RNA,结果见图3。由图3可知,在0.5~2.5 h内,核糖核酸的提取量随时间的加长而增大,2.5 h后核糖核酸提取量不再增加,而且随着时间的加长,核糖核酸在碱性条件下会有一部分水解成核苷酸而导致提取率降低[13],故核糖核酸提取的最佳抽提时间为2.5 h,核糖核酸提取率达到1.92%。

图3 提取时间对RNA提取率的影响Fig.3 The effects of reaction time on the extraction of RNA

2.4 酵母浓度对碱法核酸提取的影响

分别配置浓度为3%、6%、9%、12%、15%的毕赤酵母溶液各100 mL,调pH至 9,于95℃下抽提1.5 h,离心取上清液,调至核糖核酸等电点,过夜沉淀获得RNA,结果见图4。由图4可知,毕赤酵母浓度为6%时,核糖核酸的提取率最大(2.89%),进一步提高毕赤酵母的浓度,固液比增大,在特定时间内碱性溶液与毕赤酵母作用强度有限,影响了核糖核酸的释放,导致提取率的降低。

2.5 提取工艺的优化

根据表1的正交试验设计进行正交试验,得到正交试验的结果见表2。由极差分析可知,对碱法提取毕赤酵母核糖核酸含量的影响因素依次为:抽提温度>溶液pH>酵母浓度>抽提时间。抽提时间的影响作用最小,但如果抽提时间过长,杂质会相应地增多。根据以上分析结果,确定在本实验所选因素条件下,以酵母浓度3%,pH=10,抽提温度为100℃,抽提时间为2.5 h时,核糖核酸提取率最高。

图4 酵母浓度对RNA提取率的影响Fig.4 The effects of P.pastorisconcentration on the extraction of RNA

表2 正交试验方案设计及结果(L9(34))Table 2 Orthogonal experimental design and results

2.6 优化条件的验证

以正交实验分析法选出的最适宜提取毕赤酵母核糖核酸的条件进行5组实验,得到的核糖核酸提取率分别为 3.05%、2.98%、3.24%、3.13%、3.16%,平均提取率为3.11%

3 小结

本文研究了碱法提取毕赤酵母核糖核酸的工艺条件,单因素试验结果表明毕赤酵母核糖核酸提取的条件为:pH=9、时间 为2.5 h、温度为95℃、酵母浓度为6%。经正交试验优化确定毕赤酵母核糖核酸提取的最佳工艺条件为:pH=10,提提温度为100℃,时间为2.5 h,酵母浓度为3%,最佳工艺条件下,核糖核酸的提取率可达3.11%。目前,以毕赤酵母为表达系统开发的基因工程均采用高密度发酵进行生产,产生大量的酵母菌体,从废弃毕赤酵母泥中提取核糖核酸,是实现废弃毕赤酵母综合利用的有效途径。

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