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基于生物分子网络分析的精神分裂症功能模块挖掘

2019-04-20廖苑君陈应坚赵小蕾孙胜南覃继恒饶绍奇

生命科学研究 2019年5期
关键词:功能模块数据库功能

廖苑君,陈应坚,赵小蕾,孙胜南,林 帆,覃继恒,饶绍奇*

(广东医科大学a.公共卫生学院;b.医学系统生物学研究所,中国广东东莞523808)

精神分裂症(schizophrenia,SCZ)是一种严重影响人类生命健康和生存质量的复杂性精神疾病,患病率约为1%,遗传贡献高达83%[1]。患者可出现幻觉、妄想、情感淡漠、社交退缩等典型精神症状,同时自知力丧失或不完整,造成严重的思维、情感、行为等多方面的障碍[2]。SCZ病症具有较高的复发率和精神症状残留,且具有不可预知性,给家庭和社会带来巨大的经济负担,并占据了大量的医疗资源,导致资源利用价值下降。在此背景下,研究SCZ病因与病理机制对其预防及治疗具有重要的意义。目前,大规模组学数据的发展为研究遗传学机制提供了便利,然而分析方法主要采用的是单位点、单基因分析策略[3]。由于SCZ病因复杂,其发生、发展过程涉及多个生物分子(如基因、miRNA等),这些生物分子构成了一个复杂的网络,因此与单位点、单基因分析方法相比,生物分子网络分析能够更加全面揭示SCZ的分子机制[4]。

在生物分子网络分析中,节点代表生命体内的各种分子,边(网络连接)代表分子间的互作关系。根据对象的不同,生物分子网络可分为基因调控网络、蛋白质互作网络、信号转导网络等[5]。迄今为止,生物分子网络分析在生物医学领域已被广泛应用,具有成熟的分析方法,可用来筛选和挖掘网络中关键的核心节点及功能模块,从而提示具有重要生物学意义的生物联系或功能结构。……

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