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多位点序列分型技术在热带念珠菌中的应用研究

2019-01-21王影项明洁刘锦燕叶书来周馨

中国真菌学杂志 2018年6期
关键词:耐药研究

王影 项明洁 刘锦燕 叶书来 周馨

(1.中国科技大学附属第一医院检验科,合肥 230001;2.上海交通大学附属瑞金医院检验科,上海 200025;3.上海交通大学附属瑞金医院卢湾分院放免检验科,上海 200020)

念珠菌是一类条件致病性真菌,是目前临床上真菌感染的主要致病菌,常见的有白念珠菌、热带念珠菌、光滑念珠菌和近平滑念珠菌等[1-2]。近年来,随着广谱抗生素和免疫抑制剂的使用,使得念珠菌的感染率日渐上升[3]。虽然在临床念珠菌的感染中白念珠菌最常见,但是由非白念珠菌类菌株引起的感染,其发病率和死亡率呈逐年上升趋势,其中以热带念珠菌较常见[4]。国内的一些研究显示,热带念珠菌分离率已成为非白念珠菌中第二位或者第三位[5-7]。

分子生物学技术已广泛应用于鉴定念珠菌基因型别以及菌株间致病相关性的研究,其中,基因分型是一种重要的微生物流行病学研究工具[8-9],而MLST分型技术是目前公认的最有权威的分型方法。Arianna等[10]已在2005年建立了热带念珠菌MLST分型数据库 (https://pubmlst.org/ctropicalis/)。热带念珠菌MLST分型是基于对其6对管家基因的单核苷酸多态性 (single nucleotide polymorphisms,SNPs)的分析,这6对管家基因分别是ICL1,MDR1,SAPT2,SAPT4,XYR1和ZWF1a。通过基因PCR扩散、测序得到临床菌株各管家基因的序列,与数据库比对得到每个管家基因的等位基因号,再根据6个管家基因的基因号的组合得到每个菌株的二倍体序列型DST。目前,国内对热带念珠菌MLST型别的研究较少,此次研究旨在探究本地区临床菌株的优势MLST型别。

1 材料和方法

1.1 材料

菌株来源 本研究所用的的92株临床热带念珠菌均来自于上海市瑞金医院自2012~2015年的住院及门急诊的71名患者 (53名男性,18名女性)。……

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