天津市锦鲤疱疹病毒PCR检测与序列分析
2018-12-21霍奕安刘荣荣胡秀彩吕爱军孙敬锋陈成勋
霍奕安,刘荣荣,胡秀彩,吕爱军,孙敬锋,陈成勋
(1. 天津农学院水产学院,天津市水产生态及养殖重点实验室,天津 300384;2. 天津农学院创新创业实验室,天津 300384)
锦鲤疱疹病毒(Koi herpesvirus,KHV)又称为鲤科疱疹病毒3型(CyHV-3),是引起高度传染性锦鲤疱疹病毒病(KHVD)的病原[1-3]。1998年KHV首次在以色列和美国引发疫情,2002年在我国广东省被发现,随后陆续到传播到我国其他地区。至今已有30多个国家或地区陆续报道发生该病[4]。KHVD潜伏期长,突发性高,给鲤鱼养殖业造成了严重危害。目前来自不同国家的4个KHV DNA全基因序列已被测序[5]。病毒检测和减毒疫苗免疫是KHVD最主要的控制措施[6]。
锦鲤是我国观赏鱼的主要养殖品种之一,在国内淡水养殖鱼类中占很大比例,一旦暴发KHVD,往往带来巨大经济损失,所以开展KHV相关研究十分重要。2017年6月,天津市滨海新区、北辰区等一些养殖场的锦鲤陆续大量发病死亡,3 d内死亡率高达85%。病鱼表现烂鳃、鳃丝发白、鳞片脱落等症状,以及内脏器官出血、糜烂等剖检病变,疑似感染KHV。本研究根据KHV基因序列分别设计合成TK、SphI-5、ORF25、ORF56和ORF81基因特异性引物,采用PCR技术检测KHV相关功能基因,为KHVD诊断及流行病学分析提供技术参考。
1 材料与方法
1.1 试验鱼、试剂及仪器
试验鱼:天津市滨海新区、北辰区等一些养殖场送检的发病锦鲤,平均体长为(6±0.5)cm;试剂及仪器:DL 2 000 bp DNA Marker(天津生工生物公司),DNA提取试剂盒、PCR Master Mix(天根生化科技有限公司),Buffer蓝DNA染料(北京鼎国昌盛生物技术公司),PCR扩增仪(德国Analytikjena公司)。
1.2 引物设计与合成
根据GenBank数据库登录的KHV TK、SphI-5、ORF25、ORF56、ORF81基因序列(AP008984.1),利用Primer Premiers 5.0软件设计特异性引物(表1)。……
