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丙型肝炎患者血清病毒宏基因组学研究*

2018-06-29周成林

检验医学与临床 2018年12期
关键词:检测

李 旺,倪 萍,周成林

(江苏省泰州市人民医院检验科 225300)

病毒宏基因组学方法在病毒学研究方面具有独特优势,它既能够检测标本中的已知病毒,又能够检测标本中的未知病毒。目前,病毒宏基因组学方法已得到广泛应用。KRABERGER等[1]应用病毒宏基因组学方法从污水处理池发现了许多新的单链环形DNA病毒。杨凡力等[2]同样应用病毒宏基因组学方法在蝙蝠体内发现腺病毒、圆环病毒、细小病毒、博卡病毒等新病毒。ZHANG等[3]应用病毒宏基因组学方法在牛肉中检测与感染灵长类多瘤病毒亲缘关系最近的牛多瘤病毒(BPyV2-SF)。用病毒宏基因组学方法对腹泻儿童及健康儿童的粪便标本进行检测,发现腹泻标本中主要存在指环病毒、杯状病毒和Salivirus,而正常儿童粪便标本中最多的病毒依次为指环病毒、Tymovirus和人双埃可病毒。此外,两组标本中病毒序列数量相差甚远,并且首次在中国儿童腹泻粪便标本中发现了第4基因群型(诺如病毒)。应用病毒宏基因组学方法对儿童呼吸道标本和脑脊液样本进行研究显示,不同标本及不同健康状态下病毒群体的组成存在一定差异。丙型肝炎是由丙型肝炎病毒(HCV)引起的一种传染性疾病,全球有1.3~2.1亿人感染HCV并转变为慢性感染者,对人类的健康造成严重威胁[4]。因此,进行HCV致病机制及相关性研究对于预防和治愈丙型肝炎有重要意义。本研究应用病毒宏基因组学方法对HCV-RNA阳性血清标本进行研究,以了解HCV-RNA阳性血清样本中病毒群落的组成,并与健康人群血清病毒群落的组成进行比较,发现二者之间病毒组成的差异性,为探索和研究与丙型肝炎相关的其他病毒提供前期研究基础,现报道如下。……

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