陕西省韩城市利什曼原虫SSU rRNA基因系统发育研究
2018-06-21,,2,,,,
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利什曼原虫所致的利什曼病,可分为内脏利什曼病(又称为黑热病)、黏膜皮肤利什曼病和皮肤利什曼病。引起不同临床类型的利什曼原虫在形态结构上没有明显差别,传统方法对虫株的鉴别主要依靠流行病学及临床资料[1]。基于分子研究的方法已被广泛运用于微生物和寄生虫的分类,相别于传统方法,具有快速、准确,且可与国内外数据比对构建进化关系的特点。SSU rRNA是真核生物一个较保守的基因,但在原虫的不同种间的变异比原核生物还要大,可用于原虫种属之间亲缘关系的研究[2-3]。本文研究分析了陕西省韩城市利什曼原虫标本的SSU rRNA基因片段,与国内外发表的该基因数据库进行比对,从分子水平确立陕西省利什曼原虫种属分类地位。
1 材料与方法
1.1 陕西省利什曼原虫阳性标本
1.1.1虫株标本 采集病犬及病例骨髓标本,以NNN培养基25 ℃进行培养,第10 d收集培养液镜下观察,发现有前鞭毛体存在者为培养阳性。取培养液用QIAamp DNA Mini Kit(Qiagen公司生产)提取基因组DNA。
1.1.2病例标本 3例有黑热病疫区接触史,症状典型的病例,取骨髓穿刺液,瑞氏染色,镜下观察发现典型利杜体者为阳性,取骨髓液用QIAamp DNA Mini Kit提取基因组DNA。
1.1.3媒介标本 采集病区白蛉标本,单只装管,冷冻研磨砂,以天隆动物组织基因组核酸提取试剂盒(西安天隆公司生产)提取基因组DNA,以kDNA引物RV1、RV2及K13A、K13B[4]扩增阳性者作为媒介感染的阳性标本。
1.2 SSU rRNA基因序列扩增及测序
1.2.1SSU rRNA引物及扩增条件 参照文献[5],研究序列SSU rRNA的上游引物为R222:TATTGGAGATTATGGAGCTG;下游引物R333:AAAGCGGGCGCGCGGTGCTG。……
