运用数字PCR检测乳腺癌组织FFPE样品中人表皮生长因子受体2拷贝数的变化
2018-06-13董周寰张晶王哲许程程王芳宋海峰付洁石怀银
董周寰,张晶,王哲,许程程,王芳,宋海峰,付洁,石怀银
1.解放军总医院 病理科,北京 100853;2.军事科学院 军事医学研究院 生命组学研究所,蛋白质药物国家工程研究中心,北京 102206;3.北京金则医学科技发展有限公司,北京 102206;4.军科正源(北京)药物研究有限责任公司,北京 102206
人表皮生长因子受体2(human epidermal growth factor receptor-2,HER2,又称 ERBB2)是人表皮生长因子家族成员,其基因位于17号染色体。HER2过表达是促发多种肿瘤发生发展的关键因素,也是靶向治疗选择的关键指标之一[1-3],抗体药物赫赛汀可有效治疗约25%的HER2高表达型乳腺癌[4]。研究表明,除乳腺癌外,胃癌等癌症中HER2基因拷贝数会发生变异[5-6],因此准确考察HER2基因拷贝数变化(copy number varia⁃tion,CNV),对于靶向治疗意义重大。
目前临床上常通过免疫组化(immunohisto⁃chemistry,IHC)和荧光免疫杂交(fluorescence in situ hybridization,FISH)的方法进行靶点确证,判断患者疾病进程,但研究表明HER2检测有10%~20%结果无法准确反映[7],主要因素为:①操作者技术水平影响;②结果评判存在主观性;③肿瘤的异质性导致取样偏差[7-8]。另外,FISH是用探针检测切片样品中HER2、CEP-17的信号,通过HER2、CEP-17荧光信号的比值来评价HER2的扩增程度,但有文献报道CEP-17本身可能也会异常扩增[9],仅以其作为内参基因可能会导致部分患者不能受益于HER2靶向治疗。
虽然FISH是目前检测HER2CNV的金标准,但由于上述局限性,以及通量低成本较高,仍需要更为准确、客观、较高通量、成本较低的检测技术加以辅助甚至替代。数字PCR(droplet digi⁃talPCR,ddPCR)是目前最具潜力的检测方法之一,早在20世纪90年代就有科学家提出ddPCR的概念[10-12]。近几年,ddPCR在微生物[13]、拷贝数变异[14]、基因突变[15]等分析领域有突破性贡献。……
