猪丁型冠状病毒的分离鉴定与基因分析
2018-06-06刘怀东薛青红魏春霞才学鹏孙晓林
刘怀东,孙 淼,赵 炜,薛青红,魏春霞,才学鹏,陈 瑞,刘 灿*,孙晓林*
(1. 甘肃农业大学,兰州 730070;2. 中国兽医药品监察所,北京100081;3. 陕西诺威利华生物科技有限公司,陕西杨陵 712100)
猪丁型冠状病毒(Porcine deltacoronavirus, PDCoV)是近年来危害养猪业的重要病毒性腹泻病原,与猪流行性腹泻(Porcine epidemic diarrhoea,PED)的发病情况极为类似,临床上较难区分[1]。发病初期仔猪表现为哺乳、吃食后出现呕吐,呕吐物呈黄色或乳白色,并常伴有水样腹泻。发病后期,病猪表现为脱水、行走蹒跚以及精神沉郁等,发病严重者可能死亡[2-4]。
PDCoV属于尼多病毒目内的冠状病毒科,为含有囊膜的单链正义RNA病毒[8]。自2013年以来,在美国、韩国、中国、日本、欧洲等地检测到PDCoV的流行[9-11]。为了进一步探究PDCoV在中国的具体流行情况,对2014-2016年间采集自河北、河南、山东、广东和陕西省的56份粪便和肠组织样本进行了多种腹泻病原检测,对确认为PDCoV阳性的样本进行了病毒分离、全基因序列测定、比对分析与遗传进化分析,以期为该病的防控提供基础支撑。
1 材 料
1.1 样本 腹泻仔猪肠组织与粪便样品来自于2014-2016年间收集的河北、河南、山东、广东与陕西省等地养殖场。
1.2 细胞 ST细胞由陕西诺威利华生物科技有限公司提供。
1.3 主要试剂 病毒DNA/RNA提取试剂盒、反转录酶M-MLV、Ex Taq Premix以及PrimeSTAR Max Premix为宝生物工程(大连)有限公司产品。
2 方 法
2.1 病料前处理与核酸提取 取肠组织与粪便样品少量置于15 mL离心管,添加质量体积比为1∶5的生理盐水,使用匀浆机进行匀浆处理,然后进行3次冻融,之后于4 ℃低温离心机进行12000 r/min离心15 min,取上清液,使用病毒DNA/RNA提取试剂盒,按说明书步骤进行核酸提取。……
