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Early Access STR Kit v1对24个常染色体STR基因座和Amelogenin基因座的法医学检测

2018-06-04

法医学杂志 2018年2期
关键词:检测信息

(怀化市公安局刑事侦查支队,湖南 怀化 418000)

含有3~5个碱基重复单元的STR基因座是法医学常用遗传标记,主要表现为长度多态性,可用于个体识别及亲权鉴定[1-2]。其中,根据STR基因座核心序列结构的重复情况,可以分为简单重复结构、复合重复结构及复杂重复结构[3]。常用的毛细管电泳检测平台主要根据等位基因片段长度的大小及荧光素标记技术对STR基因座各等位基因进行读取和分析,检测方便且成本低,但无法获取内部序列结构信息[3-4]。目前,随着二代测序技术的快速发展及成本的大幅下降,基于二代测序技术对STR基因座进行分析已成为研究热点[5-6]。本研究主要采用美国Thermo Fisher Scientific公司推出的基于Ion PGMTMTorrent平台的Early Access STR Kit v1对湖南地区24名汉族无关个体进行24个常染色体STR基因座和Amelogenin基因座的分型检测,探讨二代测序技术进行STR基因座检测分析的可行性。

1 材料与方法

采集湖南地区24名汉族无关个体的外周血样本,其中男性12名,女性12名。血样均稀释至0.5ng/μL备用。采用QIAamp DNA Blood Mini试剂盒(德国QIAGEN公司)进行DNA提取,用Quantifiler®Human DNA Quantification试剂盒(美国Thermo Fisher Scientific公司)进行DNA定量。本研究采用DNA标准品9948(美国Promega公司)作为阳性对照。

采用Early Access STR Kit v1(美国Thermo Fisher Scientific公司)对上述24份检材及DNA标准品9948进行文库构建、文库定量、乳液PCR反应、文库富集、二代测序及结果分析。文库构建PCR体系为20μL,包括EA STR PCR 2.5×PCR反应混合物 v1 8 μL、EA STR 10×PCR引物混合物v1 2μL和基因组DNA(gDNA)1ng,其余体积用超纯水补齐。文库构建PCR采用28个循环数,具体操作参照试剂盒说明书进行。定量后文库稀释为20 pmol/L。采用Ion PGMTMHi-QTMOT2 200试剂盒(美国Thermo Fisher Scientific公司)对15μL稀释文库进行乳液PCR及富集反应。……

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